Cílem mé diplomové práce bylo vytvoření algoritmu pro chemicky správné vyhodnocení nalezených tunelů v molekulách proteinů. K přesnému určení tunelů byla provedena podrobná analýza výsledků blokování molekul a na základě měrení bylo blokování přizpůsobováno a upravováno. Dále byla vytvořena testovací aplikace, která skupiny dosažených tunelů porovnávala s publikovanými a ověřenými tunely. Všechny dosažené výsledky práce byly konzultovány s odborníky na biochemii.