Abstrakt
Transkripce eukaryotických genů kódujících proteiny vyžaduje
pohyb RNA polymerázy II (Pol II)
podél chromatinu. Kombinace různých posttranslačních značek na
Pol II, na jednotlivých histonech,
nukleozomech a nukleozomálních doménách mají různou funkci a
regulují přístupnost chromatinu
pro různé transkripční a nukleozomové vazebné faktory. Ačkoli
funkční, biochemická a strukturní
data naznačují, že transkripční faktory a histonové chaperony
mohou mít klíčovou roli v několika
mechanisticky odlišných procesech, mechanismus, jak spolu tyto
jednotlivé funkce souvisí, není
doposud znám. Náš výzkum je zaměřen na transkripční elongační
faktory a objasnění jejich funkcí.
Disertační práce začíná teoretickým přehledem procesu
transkripce a RNA polymeráz. Následuje
popis elongace transkripce a transkripčních faktorů. Genomové
uspořádání a histonové chaperony
jsou zde popsány pro pochopení vzájemné dynamiky mezi
chromatinem a Pol II. Zvláštní pozornost
je věnována našemu hlavnímu objektu výzkumu - transkripčnímu
elongačnímu faktoru a
histonovému chaperonu Spt6.
Experimentální část zahrnuje tři výzkumné články. Naše studie
demonstrují důležitost N a C
koncových částí Spt6, odkrývají autoregulační mechanismus a
navrhují strukturní organizaci
proteinu. Strukturní data poukazují na organizaci domén Spt6 a
upevňují koncept regulace funkcí
Spt6. Data prezentovaná v publikacích nabízí fundamentální
mechanistický pohled na multifunkční
chování Spt6 a jsou podstatné pro pochopení vzájemné dynamiky
mezi Pol II a chromozomy. Navíc
jsme ve spolupráci se skupinou Dea Slade (Max Perutz Labs,
University of Vienna) objevili nového
vazného partnera Pol II CTD PHF3.
Disertační práci uzavírá obecná diskuze o prezentovaných
publikacích spolu se závěry a shrnutím
perspektivy pro danou oblast výzkumu.