Diplomová práce

Využití metody CRISPR/Cas9 ke snižování exprese miR-135b v buňkách kolorektálního karcinomu

Use of CRISPR/Cas9 method for downregulation of miR-135b in colorectal carcinoma cells

Bc. Adriána Zbončáková
Anotace

MikroRNA (miRNA), řazené do skupiny krátkých nekódujících RNA, patří mezi významné regulátory jak fyziologických, tak i patofyziologických procesů. MiRNA hrají často klíčovou roli v procesech provázejících maligní transformaci, kde mohou fungovat jako onkogeny nebo nádorové supresory. Souvislost mezi změnou exprese některých miRNA a maligním fenotypem byla popsána i v případě kolorektálního karcinomu …více

Abstract

MicroRNAs (miRNAs), a group of short non-coding RNAs, are important regulators of both physiological and pathophysiological processes. MiRNAs often play a key role in the processes accompanying malignant transformation, where they may function as oncogenes or tumour suppressors. A link between altered expression of some miRNAs and malignant phenotype has been reported in colorectal carcinoma, which …více

Zadání práce
MikroRNA (miRNA), řazené do skupiny krátkých nekódujících RNA, patří mezi významné regulátory jak fyziologických, tak i patofyziologických procesů. MiRNA hrají často klíčovou roli v procesech provázejících maligní transformaci, kde mohou fungovat jako onkogeny nebo nádorové supresory. Souvislost mezi změnou exprese některých miRNA a maligním fenotypem byla popsána i v případě kolorektálního karcinomu, který patří celosvětově mezi nejčastější nádorová onemocnění. Několik prací, které se zabývaly stanovením expresních profilů miRNA v nádorové tkáni, upozornily na miR-135b, jejíž exprese je v nádoru významně snížena v porovnání se zdravou střevní sliznicí. Cílené snížení exprese miR-135b v buňkách kolorektálního karcinomu by mohlo ovlivnit jejich maligní fenotyp. Diplomová práce bude zaměřena na získání stabilních buněčných linií odvozených od kolorektálního karcinomu se sníženou expresní hladinou miR-135b. Získané linie poslouží k dalšímu studiu funkce miR-135b. Cílem teoretické části diplomové práce bude orientace v problematice biotechnologických postupů cíleného vytváření mutací s orientací na metodiku CRISPR/Cas9 a pokroky v mutagenezi nekódujících RNA. Experimentální část práce bude obsahovat osvojení manipulace se stabilními buněčnými liniemi in vitro, dále osvojení postupů spojených s cíleným vnášením mutací a dalších molekulárně-biologických postupů, které budou následně použity k validaci a charakterizaci získaných mutantních monoklonálních buněčných linií.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2022 13:37, RNDr. Kamila Součková, Ph.D., učo 11949
Plný text práce
3,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
15. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Kamila Součková, Ph.D., učo 11949
MOnkII CMM CEITEC MU

Oponent

Mgr. Jiří Štika, Ph.D., učo 8741
LGen CMM CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Matej Jasík, učo 453421
MOnkII CMM CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.