Propojení mezi cytokininy a epigenetickými mechanismy vytváří složitý systém umožňující rostlině regulovat růst a vývoj v reakci na změnu prostředí. Tato diplomová práce se soustředí na mechanistické propojení cytokininové signalizace a procesy histonových modifikací, a to skrze homeodoménový protein HAT3.1. V teoretické části jsou shrnuty poznatky o biosyntéze, metabolismu a signalizaci cytokininů v souvislosti s epigenetickými procesy. Dále je přiblížen gen HAT3.1 a jeho pravděpodobná interakce s histony, zejména modifikace H3K4me0. V experimentální části je popsán vliv exogenního působení cytokininů na úroveň exprese HAT3.1 pomocí kvantitativní PCR a glukuronidového barvení rostlinných linií obsahujících transkripční fúzi genového promotoru. Tímto bylo zjištěno negativní působení cytokininů na expresi HAT3.1, které je zprostředkováno skrze ARR1 a pravděpodobně též ARR12. Negativní efekt cytokininů na expresi HAT3.1 byl pozorován u klíčních rostlin a stonkového apexu, především v oblastech laterálních kořenů a květních pupenů. Dále byly testovány interakce HAT3.1 a ARR proteinů pomocí kvasinkového dvouhybridního systému. Žádná z testovaných interakcí nebyla v použitém systému prokázána. Souhrnně prezentované výsledky ukazují, že cytokininy pletivově specificky modulují expresi HAT3.1 skrze kanonické transkripční faktory ARR typu B, s důrazem na roli ARR1.