Diplomová práce

Charakterizace interakčních partnerů telomerázy v modelové rostlině Arabidopsis thaliana

Characterization of putative interaction partners of telomerase in Arabidopsis thaliana model plant

Bc. Petra Kováčiková
Anotace

Telomeráza je enzým s funkciou reverznej transkriptázy, ktorý nahrádza straty telomérovej DNA vznikajúce pri replikácii chromozómov, ale pôsobí aj mimo telomér. V predchádzajúcej štúdii bol identifikovaný nový interakčný partner telomerázy – proteín ARM obsahujúci vo svojej štruktúre „armadillo/β-catenin-like“ repetície. V tejto práci sme skúmali vplyv polohy T-DNA inzercie v géne kódujúcom proteín …více

Abstract

Telomerase is an enzyme with a reverse transcriptase function, that compensates for the loss of telomeric DNA that occurs during chromosome replication, but it is supposed to act also outside the telomeres. A previous study identified a new telomerase interaction partner – ARM protein containing armadillo/β-catenin-like repeats. In this study, we investigated the effect of the position of T-DNA insertion …více

Zadání práce
Telomeráza je enzym, jehož primární funkcí je prodlužování telomer, struktur ohraničujících lineární eukaryotické chromozomy. Vzhledem k tomu, že telomery jsou nepostradatelné pro integritu genomu, je studiu telomerázy, která je zásadním faktorem v zachování stability telomer, věnována velká pozornost. Rostliny jsou z hlediska biologie telomer a telomerázy zajímavým modelem, protože mechanismy vývojové regulace telomer vykazují poměrně zásadní odlišnosti ve srovnání s modely živočišnými. Během našeho předchozího výzkumu byly v modelové rostlině Arabidopsis thaliana identifikováni interakční partneři proteinové podjednotky telomerázy a náplní diplomové práce bude jejich další charakterizace. Studentka se bude zabývat analýzou rostlin s inzercí T-DNA v různých částech genu kódujícího protein ARM, jehož interakce s telomerázou je detailně studovaná. Bude stanovena míra poklesu hladiny transkriptu arm v homozygotních mutantních liniích a v těchto rostlinách bude analyzována délka telomer, aktivita telomerázy a citlivost na přítomnost látek způsobujích různé typy poškození DNA včetně kvantitativní analýzy transkripce tzv. “core DNA repair genes”. Výsledky získané v rámci této diplomové práce přispějí k objasnění zapojení rostlinné telomerázy do telomerových i netelomerových buněčných procesů. Literatura: Fitzgerald MS, McKnight TD, Shippen DE. (1996) Characterization and developmental pattern of telomerase expression in plants. Proc Natl Acad Sci USA, 93, 14422-14427. Majerská J, Sýkorová E, Fajkus J. Non-telomeric activities of telomerase (2011). Mol Biosyst, 7, 1013-1023. Lee LY, Wu FH, Hsu CT, Shen SC, Yeh HY, Liao DC, Fang MJ, Liu NT, Yen YC, Dokládal L, Sýkorová E, Gelvin SB, Lin CS (2012). Screening a cDNA library for protein-protein interactions directly in planta. Plant Cell, 24, 1746-1759. Dokladal L, Honys D, Rana R, lee LY, Gelvin SB, Sýkorová E (2015). cDNA library screening identifies protein interactors potentially involved in non-telomeric roles of Arabidopsis telomerase. Front Plant Sci, 12, 985. Majerská J, Schrupmfová PP, Dokládal J, Schořová Š, Stejskal K, Obořil M, Honys D, Kozáková L, Polanská PS, Sýkorová E (2017). Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo. Protoplasma, 254, 1547-1562. Dokládal L, Benková E, Honys D, Dupláková N, Lee LY, Gelvin SB, Sýkorová E (2018). An armadillo-domain protein participates in a telomerase interaction network. Plant Mol Biol, 97, 407-420.
Práce zkontrolována:
13. 8. 2020 08:27, doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
Plný text práce
2,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 9. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D., učo 11554
NCBR PřF MU

Konzultant

Mgr. Klára Přikrylová, Ph.D.
MKChr MCGPR CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.