Diplomová práce

Charakterizace minoritního stavu sigma podjednotky RNA polymerázy z bakterie Bacillus subtilis

Characterisation of low populated state of sigma subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis

Bc. Dávid Tužinčin, učo 460988
Anotace

Transkripce je nezbytný proces pro život buněk, který je přesně regulován. U bakterií je tento proces zprostředkován prostřednictvím enzymu RNA polymerázy. K zahájení transkripce je nezbytný další protein, sigma podjednotka. Jeho doména, sigma1.1, je zodpovědná za autoinhibici sigmy ve volném stavu a v počátečních stádiích iniciace transkripce sigma1.1 zabírá kanál vázající DNA. Tato práce se zaměřuje …více

Abstract

Transcription is essential process for cell life, which is precisely regulated. In bacteria, this process is mediated through enzyme RNA polymerase. In order to initiate transcription additional protein is necessary, the sigma subunit. Its domain, sigma1.1, is responsible for the autoinhibition of sigma in the free state and in the early stages of transcription initiation sigma1.1 occupies the DNA …více

Klíčová slova
sigma1.1 RNA polymeráza nukleární magnetická rezonance dynamika minoritní stav Bacillus subtilis sigma1.1 RNA polymerase nuclear magnetic resonance dynamics minor state Bacillus subtilis
Zadání práce
This project is focused on the characterization of component of the RNA polymerase of Gram positive bacteria with a detected conformational exchange. The minor state of 1.1 subregion of the sigma subunit of the RNA polymerase will be studied. Sigma-A subunit of RNA polymerase is a subunit required for the transcribing of genes during log-phase of the cell growth. Its subregion 1.1 has an autoinhibition function. Within this study, we focus on the characterization of the excited states of this molecule by combination of the advanced methods of nuclear magnetic resonance like a relaxation dispersion experiment, CEST experiments, and analysis of residual dipolar couplings. The experiments will be performed both at uniformly and selectively isotopically labeled NMR samples of sigma 1.1 subregion prepared in the first step of the work.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
10. 6. 2021 21:41, Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653
Plný text práce
9,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
24. 6. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653
BNMRS CSB CEITEC MU

Oponent

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564
NMR CSB CEITEC MU

Konzultant

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biomolekulární chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.