Bakalářská práce

Learning to Predict Prostate Cancer Using Slide-level Annotations

Michal Jakubík
Anotace

Zapojenie algoritmov umelej inteligencie do diagnostiky rakoviny predstavuje významný pokrok v lekárskej diagnostike. Štandardná metóda trénovania neurónovej siete na detekciu rakoviny si vyžaduje nákladné a časovo náročné podrobné anotácie od patológov. V tejto práci je natrénovaných niekoľko modelov konvolučných neurónových sietí na datasetoch, ktoré disponujú iba informáciou o prítomnosti rakovinového …více

Abstract

The involvement of artificial intelligence algorithms in cancer diagnosis represents a significant advancement in medical diagnostics. A standard method of training a neural network for cancer detection requires expensive and time-consuming detailed annotations from expert pathologists. In this thesis, several convolutional neural network models are trained on datasets which only posses information …více

Zadání práce
Prostate cancer is one of the most common types of cancer among men worldwide, and early detection is crucial for effective treatment. The involvement of artificial intelligence in the detection process represents a significant advancement in medical diagnostics. A standard method to train a neural network for this task requires time-intensive, detailed pixel-level annotations by skilled pathologists, which are time-consuming and costly. In contrast, the global information, whether the whole histopathological image (slide) contains cancer, is readily available from the clinical practice. The thesis aims to train and evaluate a convolutional neural network for predicting prostate cancer using the slide-level annotations of clinical data provided by Masaryk Memorial Cancer Institute. The student will familiarise themself and present the basics of digital pathology. They will select suitable architecture and perform and asses a comparative test in the cloud infrastructure of the RationAI group. The student will optionally contribute the code to HistoPipe, the RationAI open-source library for digital histopathology.
Práce zkontrolována:
24. 5. 2024 09:18, RNDr. Vít Musil, Ph.D., učo 246021
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
24. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Vít Musil, Ph.D., učo 246021
KTP FI MU

Oponent

doc. RNDr. Petr Novotný, Ph.D., učo 172743
KTP FI MU

Konzultant

doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
KSUZD FI MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.