Tato bakalářská práce se zabývá převodem modelů dynamických systémů v biologii ve formě matematické reprezentace do interakčních sítí. V teoretické části práce jsou popsány technologie pro práci s biologickými modely, zhodnocují se existující aplikace a diskutují se jejich nedostatky. V praktické části je navržena a implementována aplikace pro převod modelů, tak aby vyhovovala požadavkům. Aplikace je navržena tak, aby bylo možno ji v budoucnu rozšířit či upravit. Aplikace by mohla být začleněna do webového portálu e-cyanobacterium.org, pro vizualizaci složitých modelů, vyskytujících se na tomto portálu.