## Structural electron microscopy
(Strukturní elektronová mikroskopie)

Rozsah:  2/0/0. 2kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující:  
Dr. Tanvir Shaikh (přednášející)  
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (přednášející) 

Předpoklady
:  Znalosti matematiky a fyziky na středoškolské úrovni

### Cíle předmětu:

Kurz nabízí úvod do elektronové mikroskopie pro strukturní biologii a vědy o živé přírodě.
Zahrnuje anatomii elektronového mikroskopu, princip tvorby obrazu a úvod do metod přípravy 
vzorků pro elektronovou mikroskopii. Studenti získají poznatky o analýze obrazů z kryo-elektronové
mikroskopie, o jednočásticové analýze a elektronové tomografii.

### Osnova:
1. Historie elektronové mikroskopie, aplikace a současné trendy
2. Uspořádání elektronového mikroskopu a princip vytváření obrazu
3. Transmisní a skenovací mikroskopie
4. Metody přípravy vzorku
5. Negativní barvení a a kryoelektronová mikroskopie makromolekulárních systémů
6. Fourierova transformace 
7. Vzorkování a multivariantní analýza
8. Jednočásticová analýza
9. 3D reknostrukční metody
10. Rozlišení a statistika
11. Elektronová tomografie
12. Interpretace EM dat ve strukturní biologii
13. Korelativní přístupy

Metody hodnocení:
Písemná zkouška

### Literatura:

1. John Kuo: Electron Microscopy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press; 3rd ed. 2014
2. R. A Crowther: The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM, Volume 579 (Methods in Enzymology) 1st Edition, Academic Press, 2016
3. Annie Cavalier, Daniele Spehner, Bruno M. Humbel: Handbook of Cryo-Preparation Methods for Electron Microscopy (Methods in Visualization), CRC Press; 1st Ed., 2008