Curriculum Vitae

Životopis

Identifikace osoby

• Mgr. Tibor Botka, Ph.D.

Pracoviště

• Masarykova univerzita
  Přírodovědecká fakulta
  Ústav experimentální biologie
  Laboratoř molekulární diagnostiky mikroorganismů
  Kamenice 5, 625 00 Brno
  

Funkce na pracovišti

• odborný asistent

Vzdělání

• 2017: Ph.D. (PřF MU, Molekulární a buněčná biologie)
  
• 2013: Mgr. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)
  
• 2011: Bc. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)

Předchozí zaměstnání

• 2013-2018 odborný pracovník (PřF MU, ÚEB)

Pedagogická činnost

• Molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie
• Laboratorní cvičení z molekulární biologie pro biochemiky
• Specializační seminář Molekulární biologie a genetika
• Laboratorní seminář Oddělení genetiky a molekulární biologie
• Vedoucí, konzultant a oponent bakalářských a diplomovych prací

Vědeckovýzkumná činnost

• řešitel:
  Grant TAČR (FW10010112): Kombinovaná fágová terapie pro podporu léčby chronických respiračních onemocnění
  Grant EMBO (EMBO9572): Interactions between therapeutic staphylococcal phages and their hosts in bacterial communities and consequences for phage-antibiotic synergy (PAS)
  Grant AZV MZ ČR (NU21J-05-00035): Synergy of lytic bacteriophages and antibiotics in the therapy of topical infections of Staphylococcus aureus
  Grant FRMU (MUNI/FR/1181/2018): Inovace metod v Praktiku z molekulární biologie virů
  
• člen řešitelského týmu:
  Projekt Národní institut virologie a bakteriologie (LX22NPO5103)
  Grant Ga ČR (GA18-13064S): Analýza interakcí mezi polyvalentním terapeutickým fágem druhu Twort-like a jeho hostitelem Staphylococcus aureus
  Grant MZe ČR (QJ1510216): Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat
  
• podíl na řešení:
  Grant MZ ČR (NT12395-5): Molekulární průkaz a analýza invazivních kmenů small colony variants (SCV) a rezistentních kmenů S. aureus od pacientů s cystickou fibrózou
  Grant MŠMT (ED0006/01/01): Centrum pro aplikovanou mikrobiologii a imunologii ve veterinární medicíně
  Grant Ga ČR (GBP206/12/G151): Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
  Grant MŠMT ČR (ED1.1.00/02.0068): CEITEC - central european institute of technology
  Projekt CEB, MŠMT OPVK (CZ.1.07/2.3.00/20.0183): Centrum experimentální biomedicíny
  

Internship and stays for the purpose of study or work

• 28. 8. 2023 – 28. 9. 2023: University of Helsinki, Helsinki, Ostatní, FIN
  • Výzkumný pobyt na University of Helsinki s cílem navázání dlouhodobé spolupráce.
  • LX22NPO5103
• 18. 7. 2022 – 2. 9. 2022: University of York, York, Ostatní, GBR
  • Vědecko-výzkumný pobyt s cílem navázat spolupráci s eko-evoluční laboratoří dr. Ville Frimana, která se zabývá vztahy fágů a jejich hostitelů, zejména rodu Pseudomonas. Laboratoř využívá celou řadu přístupů (např. využití speciálního média pro syntetický model cystické fibrózy), přičemž cílem bylo přenést tyto postupy a znalosti do domovské laboratoře (projekt EMBO9572) a využít je ve stávajících projektech zabývajících se studiem stafylokoků a jejich fágů, a to se zaměřením na vliv antibiotik na systém fág-hostitel s cílem terapeutického využití synergie (projekt NU21J-05-00035).
  • EMBO9572, NU21J-05-00035

Mimouniverzitní aktivity

• člen American Society for Microbiology
  
• člen Československé společnosti mikrobiologické
  
• člen Genetické společnosti Gregora Mendela
  
• člen The International Society for Viruses of Microorganisms

Vybrané publikace

• OBOŘILOVÁ, Radka; Eliška KUČEROVÁ; Tibor BOTKA; Hana VAISOCHEROVÁ-LÍSALOVÁ; Petr SKLÁDAL and Zdeněk FARKA. Piezoelectric biosensor with dissipation monitoring enables the analysis of bacterial lytic agent activity. Scientific Reports. Springer Nature, 2025, vol. 15, January, p. 1-13. ISSN 2045-2322. Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-024-85064-x. URL info
• MAŠLAŇOVÁ, Ivana; Vojtěch KOVAŘOVIC; Tibor BOTKA; Pavel ŠVEC; Ivo SEDLÁČEK; Ondrej ŠEDO; Adéla FINSTRLOVÁ; Meina NEUMANN-SCHAAL; Sarah KIRSTEIN; Sybille SCHWENDENER; Eva STAŇKOVÁ; Kristína ROVŇÁKOVÁ; Petr PETRÁŠ; Jiří DOŠKAŘ; Vincent PERRETEN and Roman PANTŮČEK. Evidence of in vitro mecB-mediated β-lactam antibiotic resistance transfer to Staphylococcus aureus from Macrococcus psychrotolerans sp. nov., a psychrophilic bacterium from food-producing animals and human clinical specimens. Applied and Environmental Microbiology. American Society for Microbiology, 2025, vol. 91, No 4, p. 1-24. ISSN 0099-2240. Available from: https://doi.org/10.1128/aem.01652-24. URL info
• BARDY, Pavol; Conor I. W. MACDONALD; Paul C. KIRCHBERGER; Huw T. JENKINS; Tibor BOTKA; Lewis BYROM; Nawshin T. B. ALIM; Daouda A. K. TRAORE; Hannah C. KOENIG; Tristan R. NICHOLAS; Maria CHECHIK; Samuel J. HART; Johan P. TURKENBURG; James N. BLAZA; J. Thomas BEATTY; Paul C. M. FOGG and Alfred A. ANTSON. Penton blooming, a conserved mechanism of genome delivery used by disparate microviruses. mBio. American Society for Microbiology, 2025, vol. 16, No 4, p. 1-23. ISSN 2150-7511. Available from: https://doi.org/10.1128/mbio.03713-24. URL info
• BOTKA, Tibor; Soňa SMETANOVÁ; Adam VINCO; Eliška KUČEROVÁ; Kristína ROVŇÁKOVÁ; Alena SIVÁKOVÁ; Ivana MAŠLAŇOVÁ and Roman PANTŮČEK. Virion content unpacked by long-read sequencing: Stress-induced changes in transmitted staphylococcal mobilome due to phage-satellite interactions. Nucleic Acids Research. Oxford, England: Oxford University Press, 2025, vol. 53, No 20, p. 1-16. ISSN 0305-1048. Available from: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1165. URL info
• KOMÁRKOVÁ, Marie; Eliška KUČEROVÁ; Alena SIVÁKOVÁ and Tibor BOTKA. Stabilní směs terapeutických bakteriofágů rodu Kayvirus a antibiotik účinných proti Staphylococcus aureus ve sprejových aplikátorech (Stable mixture of therapeutic bacteriophages of the Kayvirus genus and antibiotics effective against Staphylococcus aureus in spray applicators). 2025. info
• DVOŘÁK, Pavel; Barbora BURÝŠKOVÁ; Barbora POPELÁŘOVÁ; Birgitta E. EBERT; Tibor BOTKA; Dalimil BUJDOŠ; Alberto SÁNCHEZ-PASCUALA; Hannah SCHÖTTLER; Heiko HAYEN; Víctor DE LORENZO; Lars M. BLANK and Martin BENEŠÍK. Synthetically-primed adaptation of Pseudomonas putida to a non-native substrate D-xylose. Nature Communications. Nature Portfolio, 2024, vol. 15, No 1, p. 1-18. ISSN 2041-1723. Available from: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46812-9. URL info
• KUNTOVÁ, Lucie; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Radka OBOŘILOVÁ; Hana ŠIMEČKOVÁ; Adéla FINSTRLOVÁ; Pavol BÁRDY; Marta ŠIBOROVÁ; Liudmyla TROIANOVSKA; Tibor BOTKA; Petr GINTAR; Ondrej ŠEDO; Zdeněk FARKA; Jiří DOŠKAŘ and Roman PANTŮČEK. Staphylococcus aureus Prophage-Encoded Protein Causes Abortive Infection and Provides Population Immunity against Kayviruses. mBio. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, 2023, vol. 14, No 2, p. 1-15. ISSN 2150-7511. Available from: https://doi.org/10.1128/mbio.02490-22. Publisher info
• KOVAŘOVIC, Vojtěch; Adéla FINSTRLOVÁ; Ivo SEDLÁČEK; Petr PETRÁŠ; Pavel ŠVEC; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Meina NEUMANN-SCHAAL; Ondrej ŠEDO; Tibor BOTKA; Eva STAŇKOVÁ; Jiří DOŠKAŘ and Roman PANTŮČEK. Staphylococcus brunensis sp. nov. isolated from human clinical specimens with a staphylococcal cassette chromosome-related genomic island outside of the rlmH gene bearing the ccrDE recombinase gene complex. Microbiology Spectrum. Washington, DC: American Society for Microbiology, 2023, vol. 11, No 5, p. 1-22. ISSN 2165-0497. Available from: https://doi.org/10.1128/spectrum.01342-23. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka; Tibor BOTKA; Xin DU; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Pavol BÁRDY; Roman PANTŮČEK; Martin BENEŠÍK; Pavel ROUDNICKÝ; Volker WINSTEL; Jesper LARSEN; Ralf ROSENSTEIN; Andreas PESCHEL and Jiří DOŠKAŘ. Staphylococcus epidermidis Phages Transduce Antimicrobial Resistance Plasmids and Mobilize Chromosomal Islands. mSphere. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, 2021, vol. 6, No 3, p. 1-19. ISSN 2379-5042. Available from: https://doi.org/10.1128/mSphere.00223-21. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka; Roman PANTŮČEK; Tibor BOTKA and Jiří DOŠKAŘ. Variability of resistance plasmids in coagulase-negative staphylococci and their importance as a reservoir of antimicrobial resistance. Research in Microbiology. Amsterdam: Elsevier Science, 2019, vol. 170, No 2, p. 105-111. ISSN 0923-2508. Available from: https://doi.org/10.1016/j.resmic.2018.11.004. Full Text info
• BOTKA, Tibor; Roman PANTŮČEK; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Martin BENEŠÍK; Petr PETRÁŠ; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Pavla HAVLÍČKOVÁ; Marian VARGA; Helena ŽEMLIČKOVÁ; Ivana KOLÁČKOVÁ; Martina FLORIANOVÁ; Vladislav JAKUBŮ; Renata KARPÍŠKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Lytic and genomic properties of spontaneous host-range Kayvirus mutants prove their suitability for upgrading phage therapeutics against staphylococci. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, 2019, vol. 9, No 1, p. 5475-5486. ISSN 2045-2322. Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-019-41868-w. URL info
• DOŠKAŘ, Jiří; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Martin BENEŠÍK; Tibor BOTKA; Marcela KLIMEŠOVÁ; Renáta KARPÍŠKOVÁ and Ivana KOLÁČKOVÁ. Příprava purifikovaného fága S. aureus pro použití ve veterinární praxi (Preparation of a purified S. aureus phage for use in veterinary practice). 2018. Příprava purifikovaného fága Staphylococcus aureus pro použití ve veterinární praxi (STAF1) info
• BOTKA, Tibor; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Karla SVOBODOVÁ; Roman PANTŮČEK; Petr PETRÁŠ; Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Two highly divergent lineages of exfoliative toxin B-encoding plasmids revealed in impetigo strains of Staphylococcus aureus. International Journal of Medical Microbiology. Jena: ELSEVIER GMBH, URBAN & FISCHER VERLAG, 2017, vol. 307, No 6, p. 291-296. ISSN 1438-4221. Available from: https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2017.05.005. URL info
• TKADLEC, Jan; Eva VAŘEKOVÁ; Roman PANTŮČEK; Jiří DOŠKAŘ; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Tibor BOTKA; Libor FILA and Oto MELTER. Characterization of Staphylococcus aureus strains isolated from Czech cystic fibrosis patients: high rate of ribosomal mutation conferring resistance to MLSB antibiotics as a result of long-term and low-dose azithromycin treatment. Microbial Drug Resistance. New Rochelle, NY, USA: Mary Ann Liebert Inc., 2015, vol. 21, No 4, p. 416-423. ISSN 1076-6294. Available from: https://doi.org/10.1089/mdr.2014.0276. URL info
• BOTKA, Tibor; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Hana KONEČNÁ; Roman PANTŮČEK; Ivan RYCHLÍK; Zbyněk ZDRÁHAL; Petr PETRÁŠ and Jiří DOŠKAŘ. Complete genome analysis of two new bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. Virus Genes. Springer US, 2015, vol. 51, No 1, p. 122-131. ISSN 0920-8569. Available from: https://doi.org/10.1007/s11262-015-1223-8. URL info

2025/01/29