Závěrečná práce: Bc. Monika Michalovová: Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat
Diplomová práce
Segregační analýza za účelem identifikace pohlavně vázaných genů na základě NGS dat
Segregation analysis with goal to identify sex-linked genes based on NGS data
Anotace
Sekvenační data jsou dnes široce využívaná jak ve výzkumu, tak v diagnostice. V rámci této diplomové práce byla vytvořena sada skriptů, která slouží k detekci pohlavně vázaných genů na základě klasické segregační analýzy s využitím sekvenačních dat nové generace. Proces je plně automatizovaný, vedoucí od miliónů krátkých sekvencí (čtení) ke kandidátním pohlavně vázaným genům, které mohou být dále ověřeny…více
Abstract
Sequencing data are extensively used nowadays in both research and diagnostics. In this diploma thesis a new pipeline has been established that is capable of discovering new sex-linked genes based on classical segregation analysis, using next-generation sequencing data. The pipeline is fully automated, leading from millions of short sequences (reads) to candidate sex-linked genes that can be further…více
Zadání práce
3. 6. 2013 09:50, doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc., učo 204182
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Evoluce reprodukčních mechanismů u dvoudomých rostlin
Mgr. Tereza Králová, Ph.D. -
Mechanizmy kompenzace dávky X-vázaných genů
Mgr. Mária Saleh, učo 357445 -
Pohlavní chromozomy a jejich párování u šťovíku kyselého (Rumex acetosa)
Mgr. Jana Kružlicová -
Akumulace promiskuitní DNA a mikrosatelitů na pohlavních chromozomech rostlin
Mgr. Pavlína Motlová -
Cytomolekulární komparativní analýza polymorfního karyotypu XY/XY1Y2 u rostlinného modelu Rumex hastatulus
Mgr. Jana Kružlicová -
Charakterizace genů a repetitivní DNA u Rumex acetosa - dvoudomé rostliny s pohlavními chromosomy
Mgr. Viktor Tokan, Ph.D. -
Úloha repetitívnych sekvencií DNA v evolúcii pohlavných chromozómov rastlín
Mgr. Tomáš Čermák, Ph.D. -
Identifikace a mapování genů na pohlavních chromozomech Silene latifolia
Mgr. Martin Košař