V současné době dochází k extenzivnímu využívání sekvenačních dat nové generace pro výzkumné i diagnostické účely. Tato data umožňují odhalovat jak genomové varianty každého jednotlivce, tak jejich expresní a metylační profily ve vztahu k nemocem. V této diplomové práci proveďte na základě sekvenačních dat segregační analýzu s cílem určit kandidátní geny vázané na pohlavní chromozomy. Celý proces zautomatizujte a umožněte provádět analýzu pomocí dobře použitelného GUI. Program musí být dostupný buď ve formě webové služby, u které bude výpočet probíhat na vzdáleném stroji, nebo s jednoduchou instalací a výpočtem lokálně na stroji uživatele. Vzhledem k objemnosti zpracovávaných dat se v práci zaměřte i na časovou a prostorovou efektivnost výpočtu. Program optimalizujte pro práci s rostlinnými vzorky, kdy pro miliony krátkých čtení jak rodičů (otec, matka), tak dětí (synové, dcery), bude výstupem seznam kandidátních pohlavně vázaných genů, které mohou být dále ověřeny laboratorně (PCR, restrikce polymorfismů, FISH) a tak potvrzena platnost výpočtu.