Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii

OSNOVA A ZÁKLADNÍ INFORMACE KURZU

  1. Práce s daty v kontextu genomu (2 týdny)
  2. Práce se sekvencemi, hledání konsenzu, repetic, mapování (2 týdny)
  3. Aplikace markovovských modelů v bioinformatice (2 týdny)
  4. Konstrukce a analýza sítí genových interakcí (3 týdny)
  5. Konstrukce a analýza metabolických sítí (3 týdny)

Vzdálené připojení na linuxové stroje ze strojů počítačové učebny (win 7)

1. lokálně spustit X server: Remote access -> Xming

2. založit relaci v PuTTY a uložit její nastavení pro následné používání:

        specifické nastavení: Connection -> SSH -> X11:

  • zatrhnout Enable X11 forwarding
  • X display location nastavit na jméno_stroje:0.0 (např. dryada09.fi.muni.cz:0.0)
  • zatrhnout XDM-Auth

3. spustit relaci terminálu na linuxový stroj *.fi.muni.cz, klientské grafické aplikace by se nyní měly automaticky přes spuštěný X server exportovat na Váš desktop

 

Další způsob (MAC)

1) spustit Terminal

2) ssh -X username@biolinux.fi.muni.cz