SKUPINY V PROJEKTU:

1. Ondrejka, Hanajikova (Medlanecky rybnik)

2. Blaha, Kusnier (Breclavsko)

3. Simurka, Stanko (Studenka)

4. Guman, Huvar (Marianske udoli)

5. Kratka, Michalik

6. Zeman, Son

7. Oprchalova, Kubin, Helmelicova

========

Pokud některá dvojice projeví zájem řešit projekt z pohledu systémové biologie, nebude Vašim cílem určit druhovou skladbu analyzovaného vzorku, nýbrž jeho podpora pro přítomnost určitých signálních a metabolických drah. Výstupem by mohla být  nějaká exostická dráha, která je ve vzorku zastoupena a nějaká další, ve které některé kroky zjevně chybí.

R-Bioconductor packages applicable to analysis of sequences mapped to KEGG:

---

+

---

---

+

---

CVIČENÍ

1. Vyhledejte v databázi KEGG informace o glykolýze. Který enzym katalyzuje izomeraci glukózo-6P na fruktózo-6P? Jaké je jeho EC číslo, jaký je název? V kolika organizmech sa nachází a jaké je jeho označení a sekvence proteinu a genu v E.coli?

2. Vyberte 3 enzymy z glykolýzy a zjištěte pomoci nástroje KEGG Mapper, v jakých drahách se nachází.