1. Aprobační komise
  2. Akademický senát
  3. Asistenti ASMU
  4. Legislativní komise ASMU
  5. Ekonomická komise ASMU
  6. Volební a mandátová komise ASMU
  7. Bezpečnostní krizový výbor
  8. Disciplinární komise
  9. Emeritní profesoři
  10. Expertní skupina HR Award
  11. Mezinárodní vědecká rada
  12. Kolegium děkana
  13. Knihovní komise
  14. Rada CERPEK
  15. Ekonomická komise
  16. Ediční rada (vědecká redakce)
  17. Etická komise
  18. Etická komise pro výzkum
  19. IT komise
    • Středoevropský technologický institut
  20. Ubytovací komise
  21. Rada Kulturního centra
  22. Rada pro kulturu a umění
  23. Pedagogická komise
  24. Panel pro rovné příležitosti
  25. Komise pro přijímací řízení
  26. Redakční rada Magazínu M
  27. Rada pro informační technologie
  28. Rada pro transfer technologií a komerční spolupráci
  29. Komise pro studium
  30. Stipendijní komise
  31. Komise pro stravovací politiku
  32. Koordinační rada pro učitelství
  33. Komise pro umění
  34. Rada pro výstavbu
  35. Programová rada Univerzity třetího věku
  36. Komise pro pediatrickou specializaci
  37. Komise požárně technická a bezpečnosti a hygieny práce
  38. Kolegium rektora
  39. Kolegium ředitele
  40. Rozšířené kolegium rektora
  41. Rada pro strategické výzkumné projekty
  42. Krizový štáb
  43. Komise pro technický rozvoj
  44. Krizový výbor
  45. Komise pro vyhodnocení Ceny děkana
  46. Komise vědecké rady
  47. Rozšířené kolegium děkana
  48. Legislativní rada
  49. Oborová komise
  50. Odborná komise pro zajišťování dobrých životních podmínek pokusných zvířat
  51. Oborová rada
  52. Porada vedení
  53. Pracovní skupina pro HR Award
  54. Pracovní skupina pro infrastrukturu
  55. Pracovní skupina pro koordinaci projektu P-PooL
  56. Pracovní skupina pro restrukturalizaci Centra léčivých rostlin
  57. Pracovní skupina pro simulace v medicíně
  58. Pracovní skupina pro strategii a data ve vizuální prezentaci
  59. Rada garantů studijních programů
  60. Rozvrhová komise
  61. Rada pro rigorózní řízení
  62. Rada pro udržitelný rozvoj
  63. Rada pro vnitřní hodnocení
  64. Řídící výbor HR Award
  65. Zástupci Masarykovy univerzity v Radě vysokých škol
  66. Škodní komise
  67. Správní rada
  68. Vedení
  69. Vědecká rada