Informace o předmětu

IV110 Project in Sequence Analysis

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jan Kotrs (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 23. 9. až Po 16. 12. Po 10:00–12:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marie Krátká (cvičící)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 10:00–12:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marie Krátká (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 14:00–15:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 15. 9. až St 8. 12. St 12:00–13:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 C511

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 18:00–19:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 17. 9. až Po 10. 12. Po 12:00–13:50 A319

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 8:00–9:50 C525

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 16:00–17:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 8:00–9:50 C416

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Pá 10:00–11:50 G330

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 12:00–13:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 10:00–11:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 40 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 45 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 8:00–9:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači. IV110 je určen primárně bakalářům, obor Bioinformatika na magisterské úrovni vyžaduje absolvování IV114. V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji a dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data.

Osnova

• - Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači. IV110 je určen primárně bakalářům, obor Bioinformatika na magisterské úrovni vyžaduje absolvování IV114.

Osnova

• - Okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Předmět se v období podzim 2006 nevypisuje.

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači.

Osnova

• - Okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)