FI:PA052 Úvod do systémové biologie - Informace o předmětu

PA052 Úvod do systémové biologie

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Luboš Brim, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 16:00–17:50 B411

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Aplikovaná informatika (program FI, N-AP)
• Bezpečnost informačních technologií (program FI, N-IN)
• Bioinformatika (program FI, N-AP)
• Informační systémy (program FI, N-IN)
• Informatika (angl.) (program FI, D-IN4)
• Informatika (program FI, D-IN4)
• Informatika (program FI, N-IN)
• Paralelní a distribuované systémy (program FI, N-IN)
• Počítačová grafika (program FI, N-IN)
• Počítačové sítě a komunikace (program FI, N-IN)
• Počítačové systémy a technologie (angl.) (program FI, D-IN4)
• Počítačové systémy a technologie (program FI, D-IN4)
• Počítačové systémy (program FI, N-IN)
• Programovatelné technické struktury (angl.) (program FI, N-IN)
• Programovatelné technické struktury (program FI, N-IN)
• Služby - výzkum, řízení a inovace (angl.) (program FI, N-AP)
• Služby - výzkum, řízení a inovace (program FI, N-AP)
• Teoretická informatika (program FI, N-IN)
• Učitelství výpočetní techniky pro střední školy (program FI, N-SS) (2)
• Umělá inteligence a zpracování přirozeného jazyka (program FI, N-IN)
• Zpracování obrazu (program FI, N-AP)

Cíle předmětu

Studenti budou po absolvování tohoto kurzu seznámeni s problematikou komplexních systémů v biologii, porozumí základním principům systémové biologie a získají jasnou motivaci pro uplatnění informatických přístupů a myšlení v moderní biologii.

Osnova

• 1.Historie a zaměření systémové biologie 2. Úvod do biologických pojmů 3. Základní pojmy a principy systémové biologie 4. Získávání biologických dat - Databáze systémově biologických znalostí 5. Průběh výzkumu v systémové biologii - Uplatnění informatických metod 6. Uchopení a specifikace biologického systému - Biologické sítě a jejich rekonstrukce 7. Pojem modelu v systémové biologii -- Modelování a simulace dynamických dějů uvnitř biologických systémů 8. Příklady systémově biologického výzkumu 9. Přehled případových studií modelů živých organismů 10. Validace modelu - Vztah analýzy in silico modelu a experimentální analýzy 11. Návrh a rekonstrukce biologických systémů

Literatura

doporučená literatura
• ALON, Uri. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. Chapman & Hall/Crc, 2006. info

Výukové metody

přednáška, samostatné studium

Metody hodnocení

Zkouška je písemná. V případě zadání průběžných testů během semestru, mají tyto podíl nejvýše 30% na závěrečném hodnocení. Pomocné materiály nejsou povoleny.

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/usr/brim/vyuka/pa052.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (podzim 2010, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/fi/podzim2010/PA052