Course Information

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Timetable

Tue 12:00–13:50 B09/316

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr lichých let (2015, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr lichých let (2015, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further Comments

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught annually.
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Timetable

Fri 9:00–10:50 F01B1/709

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further Comments

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught annually.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Timetable

Fri 7:00–8:50 F01B1/709

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further Comments

Study Materials
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught annually.

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

The course is not taught in Autumn 2023

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Advanced geographical information systems in botany and zoology

The course is not taught in Autumn 2019

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites

Bi9000 GIS in botany and zoology
This course builds on Geografické informační systémy v botanice a zoologii (Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

• Plant Biosystematics (programme PřF, N-BOT)
• Plant Ecology (programme PřF, N-BOT)
• Phycology and Mycology (programme PřF, N-BOT)
• Zoology (programme PřF, N-ZOL)

Course objectives

This course builds on GIS in Botany and Zoology (Bi9000). It is designed for students of biology who want to continue working on GIS topics and want to deepen their knowledge and especially the skills of working with GIS software.

Learning outcomes

At the end of the Bi9000, students were able to work on a project independently, using several follow-up tools in a complete workflow. In   Bi9009, students learn to build GIS functions into more complex models, write or edit scripts and run it. In addition, students will learn to publish the results of these workflows, both in the form of cartographic correct map outputs, as well as in maps published in the Internet environment. Part of the course will focus on using free GIS software so students' skills are not only tied to ArcGIS. The course will also include some more sophisticated analyses that have exceeded the time capabilities of GIS in Botany and Zoology (Bi9000).

Syllabus

• Network analysis (on the example of the river network)
• 3D Surface Surface Survey (on the example of changes in the volume of river terraces)
• Linking several adjacent tools to the model
• Using a command line for recurring tasks
• Modify a script and run it, writing your own simple script
• Publishing results, advanced work with symbology
• Publishing data on the Internet using ArcGIS Server
• Publishing data in Google (KML)
• Analysis of satellite imagery
• FreeGIS software (Quantum-GIS)

Literature

recommended literature
• MITCHELL, Andy. The ESRI® guide to GIS analysis. 1st ed. Redlands, Calif.: ESRI Press, 2005, vi, 238. ISBN 158948116X. info

Teaching methods

The lessons take place in a computer classroom and consist of 10 topics processed in the form of exercises in the GIS environment.

Assessment methods

This course is finished by a colloquium.

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

Bi9009 Geographical information systems in botany and zoology II

The course is not taught in autumn 2017

Extent and Intensity

0/2/0. 2 credit(s) (plus 1 for the colloquium). Type of Completion: k (colloquium).

Teacher(s)

Mgr. Ondřej Hájek (lecturer)

Guaranteed by

Mgr. Ondřej Hájek
Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science
Contact Person: Mgr. Ondřej Hájek
Supplier department: Department of Botany and Zoology – Biology Section – Faculty of Science

Prerequisites (in Czech)

Bi9000 GIS in botany and zoology
Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I(Bi9000)

Course Enrolment Limitations

The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.

fields of study / plans the course is directly associated with

there are 6 fields of study the course is directly associated with, display

Course objectives (in Czech)

Kurz navazuje na GIS v botanice a zoologii I (Bi9000). Je určen pro studenty biologie, kteří chtějí pokračovat v práci v prostředí GIS a chtějí si prohloubit částečně znalosti, především ale dovednosti práce s GISovým softwarem. Na konci Bi9000 byli studenti schopni vypracovat samostatně projekt, při jehož zpracování použili několik na sebe navazujících nástrojů v uceleném pracovním postupu. V Bi9009 se studenti naučí řadit GIS funkce do složitějších modelů, napsat nebo upravit skript a spustit jej. Dále se studenti naučí výsledky těchto pracovních postupů publikovat, jednak formou kartograficky korektních mapových výstupů, a také formou map publikovaných v prostředí internetu. Část kurzu se zaměří na použití freeGIS softwaru tak, aby dovednosti studentů nebyly vázány pouze na ArcGIS . Náplní kurzu budou také některé složitější analýzy, které přesáhly časové možnosti kurzu GIS v botanice a zoologii I (Bi9000).

Syllabus (in Czech)

• Analýza v síti (na příkladu říční sítě)
• 3D analýza změn povrchu (na příkladu změn objemu říčních teras)
• Spojování několika na sebe navazujících nástrojů do modelu
• Využití příkazového řádku pro opakující se úlohy
• Modifikace skriptu a jeho spuštění, psaní vlastního jednoduchého skriptu
• Publikace výsledků, pokročilá práce se symbologií
• Publikace dat na internetu s použitím ArcGIS Serveru
• Publikace dat v prostředí Google (formát KML)
• Analýza družicových snímků
• FreeGIS software (pravděpodobně Quantum-GIS)

Language of instruction

Czech

Further comments (probably available only in Czech)

The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught once in two years.
Information on the per-term frequency of the course: podzimní semestr sudých let (2018, ...).
The course is taught: every week.

• Enrolment Statistics (recent)