PřF:M9203 Simulační model. v biologii - Informace o předmětu
M9203 Simulační modelování v biologii
Přírodovědecká fakultapodzim 2014
- Rozsah
- 2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Luděk Berec, Dr. (přednášející)
- Garance
- prof. RNDr. Ivanka Horová, CSc.
Ústav matematiky a statistiky – Ústavy – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav matematiky a statistiky – Ústavy – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Čt 12:00–15:50 MP2,01014a
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Matematické modelování a numerické metody (program PřF, N-MA)
- Statistika a analýza dat (program PřF, N-MA)
- Cíle předmětu
- Cílem předmětu je seznámit studenty s vybranými simulačními technikami a s aplikací těchto technik pro řešení problémů v různých biologických disciplínách, zejména pak v ekologii a epidemiologii. Předmět si také klade za cíl naučit studenty systémovému myšlení nutnému pro návrh simulačních modelů složitých systémů.
- Osnova
- 1. Seznámení s problematikou, definice systémů a modelů, základní pojmy simulace, výhody simulace, základní simulační techniky, základní principy systémového myšlení, příklady
- 2. Celulární automaty: historie, principy, současnost, aplikace v biologii, hra života
- 3. Modely řízené událostmi: plánování událostí, náhodné procesy, generování náhodných veličin, aplikace v biologii
- 4. Modely systémové dynamiky: popis systémů na globální úrovni, toky a kauzální vztahy, aplikace v biologii
- 5. Agentově orientované modely: popis systémů na úrovni „jedince“, základní principy, aplikace v biologii, programový nástroj NetLogo
- 6. Sítě: základní typy a principy jejich modelování, šíření epidemií na sítích lidských kontaktů
- 7. Nástroje pro zpracování výstupů simulačních modelů, citlivostní analýza, kombinování různých simulačních technik
- Literatura
- Ross SM (2006) Simulation. Academic Press
- Railsback SF and Grimm V (2012) Agent-based and individual-based modeling. Princeton University Press
- Kirkwood CW. System dynamics methods: a quick introduction – http://www.public.asu.edu/~kirkwood/sysdyn/SDIntro/SDIntro.htm
- Schiff JL (2008) Cellular automata: a discrete view of the world. John Wiley & Sons.
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován jednorázově.
Výuka probíhá jednou za dva týdny po 4 hodinách vždy ve čtvrtek od 12:00.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2014/M9203