Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

J 2012

Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

ZOBANÍKOVÁ, Marie, Pavol MIKOLKA, Darina ČEJKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Lei CHEN et. al.

Základní údaje

Originální název

Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

Autoři

ZOBANÍKOVÁ, Marie (203 Česká republika, garant, domácí), Pavol MIKOLKA (703 Slovensko, domácí), Darina ČEJKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lei CHEN (840 Spojené státy), Michal STROUHAL (203 Česká republika, domácí), Xiang QIN (840 Spojené státy), George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy) a David ŠMAJS (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Standards in Genomic Sciences, 2012, 1944-3277

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 2.007

Kód RIV

RIV/00216224:14110/12:00057665

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.4056/sigs.2615838

UT WoS

000314405900002

Klíčová slova anglicky

Spirochaetaceae; Treponema pallidum; syphilis

Příznaky

Mezinárodní význam

Změněno: 18. 10. 2012 09:48, Mgr. Michal Petr

Anotace

V originále

Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1 genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV

Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Citovat

ZOBANÍKOVÁ, Marie, Pavol MIKOLKA, Darina ČEJKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Lei CHEN, Michal STROUHAL, Xiang QIN, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1. Standards in Genomic Sciences. 2012, roč. 7, č. 1, s. "nestrankovano", 13 s. ISSN 1944-3277. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4056/sigs.2615838.

@article{1069120,
   author = {Zobaníková, Marie and Mikolka, Pavol and Čejková, Darina and Pospíšilová, Petra and Chen, Lei and Strouhal, Michal and Qin, Xiang and Weinstock, George M. and Šmajs, David},
   article_number = {1},
   doi = {http://dx.doi.org/10.4056/sigs.2615838},
   keywords = {Spirochaetaceae; Treponema pallidum; syphilis},
   language = {eng},
   issn = {1944-3277},
   journal = {Standards in Genomic Sciences},
   title = {Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1},
   url = {http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784},
   volume = {7},
   year = {2012}
}

TY  - JOUR
ID  - 1069120
AU  - Zobaníková, Marie - Mikolka, Pavol - Čejková, Darina - Pospíšilová, Petra - Chen, Lei - Strouhal, Michal - Qin, Xiang - Weinstock, George M. - Šmajs, David
PY  - 2012
TI  - Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1
JF  - Standards in Genomic Sciences
VL  - 7
IS  - 1
SP  - "nestrankovano"
EP  - "nestrankovano"
SN  - 19443277
KW  - Spirochaetaceae
KW  - Treponema pallidum
KW  - syphilis
UR  - http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784
L2  - http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784
N2  - Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1 genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.
ER  -

ZOBANÍKOVÁ, Marie, Pavol MIKOLKA, Darina ČEJKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Lei CHEN, Michal STROUHAL, Xiang QIN, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1. \textit{Standards in Genomic Sciences}. 2012, roč.~7, č.~1, s.~''nestrankovano'', 13 s. ISSN~1944-3277. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4056/sigs.2615838.

Podrobný výpis o publikaci