Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{1073549,
author = {Mikel, Pavel and Růžičková, Vladislava and Holochová, Pavla and Petráš, Petr and Machová, Ivana},
booktitle = {XXI. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2012, Brno, Česká republika},
language = {cze},
isbn = {978-80-210-5874-3},
title = {Molekulárně biologická charakterizace tří ETA bakteriofágů kmenů Staphylococcus aureus izolovaných v českých nemocnicích},
url = {http://tomdny.fnusa.cz/},
year = {2012}
}
TY - CONF
ID - 1073549
AU - Mikel, Pavel - Růžičková, Vladislava - Holochová, Pavla - Petráš, Petr - Machová, Ivana
PY - 2012
TI - Molekulárně biologická charakterizace tří ETA bakteriofágů kmenů Staphylococcus aureus izolovaných v českých nemocnicích
SN - 9788021058743
UR - http://tomdny.fnusa.cz/
N2 - Úvod: Kmeny Staphylococcus aureus produkující exfoliativní toxin A (ETA) jsou hlavními původci epidermolytických infekcí postihujících nejenom novorozence, ale i dospělé osoby. Gen eta kódující ETA je nesen profágem integrovaným v genomu hostitelské bakterie. Cílem této studie byla molekulárně biologická charakterizace a srovnávací analýza genomu tří ETA fágů čeledi Siphoviridae, které byly indukovány z kmenů S. aureus izolovaných v českých nemocnicích v letech 2009 a 2010. Metodika: Fágová DNA byla studována s využitím restrikční analýzy (RFLP), PCR genotypizace, sekvenace klonovaných specifických restrikčních fragmentů a PCR amplikonů a bioinformatické analýzy získaných sekvencí. Výsledky: Restrikční analýzou DNA byla odhadnuta celková velikost genomu, určena shoda restrikčních profilů a identifikace jedinečných fragmentů u studovaných fágů. Bylo zjištěno, že dva ETA fágy jsou totožné a jeden se od nich výrazně liší. Srovnání sekvencí 6 modulárních regionů u studovaných fágů s odpovídajícími sekvencemi u dříve popsaných ETA fágů potvrdilo jejich vysokou heterogenitu. Klonováním specifických restrikčních fragmentů a analýzou jejich sekvencí byly zjištěny jedinečné oblasti genomu indukovaných ETA fágů. Tyto byly porovnány se sekvencemi v databázi GenBank. Části genomu specifické pro studované ETA fágy byly využity pro návrh nové PCR metody, která umožnila odhalit výskyt nových typů ETA fágů. Závěr: Studované fágy představují jedinečné a dosud nepopsané typy ETA fágů přispívající k variabilitě a virulenci S. aureus v České republice. Dosažené výsledky potvrzují nejenom velkou heterogenitu genomu ETA fágů, ale zdůrazňují také nutnost vývoje a zdokonalování metod pro jejich detekci a klasifikaci. Práce významně přispívá k upřesnění molekulární epidemiologie a charakterizace ETA produkujících kmenů S. aureus.
ER -
MIKEL, Pavel, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Petr PETRÁŠ a Ivana MACHOVÁ. Molekulárně biologická charakterizace tří ETA bakteriofágů kmenů Staphylococcus aureus izolovaných v českých nemocnicích. In \textit{XXI. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2012, Brno, Česká republika}. 2012. ISBN~978-80-210-5874-3.
|
