2012
Toward reading the sequence of short oligonucleotides from their retention factors obtained by means of hydrophilic interaction chromatography and ion-interaction reversed-phase liquid chromatography
BITTOVÁ, Miroslava; Jan HAVLIŠ; Hana FUKSOVÁ; Blanka VRBKOVÁ; Libuše TRNKOVÁ et al.Základní údaje
Originální název
Toward reading the sequence of short oligonucleotides from their retention factors obtained by means of hydrophilic interaction chromatography and ion-interaction reversed-phase liquid chromatography
Autoři
Vydání
Journal of Separation Science, WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. 2012, 1615-9306
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele
Německo
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 2.591
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/12:00062072
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova česky
Hydrofilní interakční chromatografie; iontově-interakční kapalinová chromatografie na reverzní fázi; sekvence oligonukleotidů; penta-nukleotidy; retenční chování
Klíčová slova anglicky
Hydrophilic interaction chromatography; Ion-interaction reversed-phase liquid chromatography; Oligonucleotide sequencing; Penta-nucleotide; Retention behavior
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 16. 5. 2014 16:38, Olga Křížová
V originále
Retention characteristics of selected synthetic 5-terminal phosphate absent penta-nucleotides containing adenine, guanine, and thymine were studied in relation to their sequence by hydrophilic interaction chromatography and ion-interaction reversed-phase liquid chromatography. We have found a simple linear additive model to describe the retention order in both separation modes in regard to their sequence. Our results show that the penta-nucleotide sequence, and thus its spatial arrangement induced by the surrounding environment, is highly related to the retention properties, so it may be hypothetically used to read the sequence from the retention properties acquired under particular separation conditions.
Česky
Pomocí hydrofilní interakční chromatografie a iontově-interakční chromatografie na reverzní fázi byly sledovány retenční charakteristiky vybraných syntetických 5-penta nukleotidů, s chybějícím koncovým fosfátem na tomto konci, obsahující adenin, guanin a thymin, vzhledem k jejich sekvenci. Našli jsme jednoduchý lineární aditivní model, který popisuje retenční pořadí v obou separačních módech z hlediska jejich sekvence. Naše výsledky ukazují, že penta-nukleotidová sekvence, a tím i jeho prostorové uspořádání vyvolané okolním prostředím, velmi souvisí s retenčními vlastnostmi, a proto mohou být hypoteticky použity k čtení sekvence z retenčních vlastností získaných podle konkrétních separačních podmínek.
Návaznosti
| ED1.1.00/02.0068, projekt VaV |
| ||
| MUNI/A/0992/2009, interní kód MU |
|