Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění

ŠÁNA, Jiří, Petra FALTEJSKOVÁ, Simona HANKEOVÁ, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA and Ondřej SLABÝ. Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění (The role of long non-coding RNAs in cancers). In VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012. 2012. ISSN 1802-4475.

Basic information

• Original name: Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění
• Name (in English): The role of long non-coding RNAs in cancers
• Authors: ŠÁNA, Jiří (203 Czech Republic, belonging to the institution), Petra FALTEJSKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Simona HANKEOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Marek SVOBODA (203 Czech Republic), Rostislav VYZULA (203 Czech Republic) and Ondřej SLABÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012, 2012.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 30200 3.2 Clinical medicine
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14740/12:00062156
• Organization unit: Central European Institute of Technology
• ISSN: 1802-4475
• Keywords (in Czech): nekódující RNA; microRNAs; siRNAs; piRNAs; lncRNAs; nádorová onemocnění
• Keywords in English: non-coding RNAs; microRNAs; siRNAs; piRNAs; lncRNAs; cancer

Abstract

Většinu eukaryotického genomu představují DNA sekvence, které nekódují proteiny. Tyto sekvence jsou přepisovány buď podle vývojového programu daného organizmu, nebo v rámci odpovědi na vnější signály. Výsledkem transkripce takových sekvencí je pak velké množství dlouhých nekódujících RNA (lncRNA). Celogenomvé studie předpokládají existenci více než 3 300 lncRNA. Dlouhé nekódující RNA jsou definovány jako molekuly nekódujících RNA o délce více než 200 nukleotidů. Ačkoli bylo dosud funkčně charakterizováno pouze omezené množství lncRNA, jejich regulační potenciál je již dnes evidentní. LncRNA hrají klíčové role jak v tanskripčních, tak v posttranskripčních regulačních drahách. U mnoha nádorových onemocnění dochází k deregulaci lncRNA, co společně s jejich funkčními vlastnostmi naznačuje jejich potenciál v procesech maligní transformace. Jednou ze tříd lncRNA jsou přepisované vysoce konzervované oblasti (T-UCR) vyznačující se vysokou homologií mezi ortologními oblastmi lidského, potkaního a myšího genomu. V současné době je známo 481 takových sekvencí. Z funkčního hlediska se T-UCR jeví jako inhibitory proteinkódujících genů a některých nekódujících RNA, včetně mikroRNA. Nedávané studie naznačily, že epxrese T-UCR je u vybraných nádorových onemocnění deregulována a dokonce koreluje s klinicko-patologickými charakteristikami pacientů. Výsledky naší práce budou zaměřené na studium T-UCR u CRC.

Abstract (in English)

The main part of eukaryotic genom is represented by DNA sequences that do not encode proteins. These sequences are transcribed according to developmental programm of particular organism or as an answer on external signals. It results in existence of large amount of long non-coding RNAs (lncRNAs). Whole-genome studies suppose that more than 3 300 lncRNAs exist. lncRNAs are defined as molecules of non-coding RNAs that are longer than 200 nucleotides. Up to now, only several lncRNAs have to been characterized, however, their regulatory potencial is evident. They play key roles in transcriptional as well as in post-transcriptional regulatory processes. They are often deregulated in different types of cancers and can affect the processes of malignant transformation. One of the class of lncRNAs are transcribed ultraconserved regionsa (T-UCR) that are highly homologic among human, rat and mouse genomes. Currently, 481 T-UCRs are known. They probably function as inhibitors of protein-coding genes and some non-coding RNAs including miRNAs. Recent studies proved that expression of T-UCR is deregulated in different types of cancers and correlates with clinical-pathological characteristics of patients. The results of our research are focused on the study of T-UCRs in CRC samples.

Links

• ED1.1.00/02.0068, research and development project: Name: CEITEC - central european institute of technology
• NT13514, research and development project: Name: Analýza mikroRNA v glioblastomových kmenových buňkách: predikce léčebné odpovědi a identifikace nových terapeutických cílů u pacientů s glioblastomem