a 2012

Identification of cytokinin receptors of Brassica napus

KUDEROVÁ, Alena, Katarína KURICOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, Anna ČURDOVÁ, Lenka MICENKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Identification of cytokinin receptors of Brassica napus

Autoři

KUDEROVÁ, Alena (203 Česká republika, domácí), Katarína KURICOVÁ (703 Slovensko, domácí), Eliška NEJEDLÁ (203 Česká republika, domácí), Anna ČURDOVÁ (703 Slovensko, domácí), Lenka MICENKOVÁ (703 Slovensko, domácí), David ŠMAJS (203 Česká republika, domácí) a Jan HEJÁTKO (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Functional Genomics and Proteomics for Sustainable Agriculture book of abstracts, a conference commemorating the 190th birth anniversary of Gregor Mendel, Brno, 13th-14th June 2012, 2012

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14740/12:00064588

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

ISBN

978-80-7375-624-6

Klíčová slova anglicky

plant hormone- multistep His-Asp phosphorelay-cytokinin receptor-CHASE-containing histidine kinase-Arabidopsis-Brassica napus-JBnB library-heterologous hybridization-gene structure-BnCHK
Změněno: 27. 5. 2013 12:08, RNDr. Alena Kuderová, CSc.

Anotace

V originále

Cytokinins (CK) belong to a group of plant hormones, playing crucial role in plant growth and development. CK signal is transduced through a multistep phosphorelay where the phosphoryl group is transferred between His and Asp residues. Cytokinin perception has been well-studied and the CHASE-containing sensor His kinases (CHKs) have been shown to be important morphological factors in Arabidopsis. As Brassica napus shares a high degree of nucleotide identity in coding regions with Arabidopsis, we used sequences of A. thaliana His kinase genes (AHKs) to search for their orthologs in B. napus (BnCHKs). Experimental screen of bacterial artificial chromosome (BAC) genomic DNA library of B. napus, var. Tapidor (JBnB), resulted in identification of redundant number of overlapping BAC clones, which hybridized with PCR-generated probes derived from sequences of phylogenetically conserved AHK regions. Five selected clones have been sequenced and defined as CK receptors by computational analysis. Based on prediction, gene-specific primers have been designed and coding- as well as untranslated cDNA regions cloned. Gene structure analysis and prediction of conserved structural domains of five BnCHK proteins are presented. Four homologues of AHK2 and one homologue of AHK3 have been identified by this experimental approach.

Návaznosti

LC06034, projekt VaV
Název: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací