Fast Tracking of Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model

MAŠKA, Martin, Arrate MUÑOZ-BARRUTIA a Carlos ORTIZ-DE-SOLÓRZANO. Fast Tracking of Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model. Online. In 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. Barcelona: IEEE, 2012, s. 1316–1319. ISBN 978-1-4577-1857-1.

Základní údaje

Originální název

Fast Tracking of Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model

Autoři

MAŠKA, Martin, Arrate MUÑOZ-BARRUTIA a Carlos ORTIZ-DE-SOLÓRZANO

Vydání

Barcelona, 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, od s. 1316–1319, 4 s. 2012

Nakladatel

IEEE

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

elektronická verze "online"

Odkazy

URL

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-1-4577-1857-1

ISSN

UT WoS

000312384100337

Klíčová slova anglicky

Cell tracking;Chan-Vese model;fluorescence microscopy;level set framework

Štítky

cbia-web

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

We present a fast and robust approach to tracking whole fluorescent cells in time-lapse series. The proposed tracking scheme involves two steps. First, coherence-enhancing diffusion filtering is applied on each frame to reduce the amount of noise and enhance flow-like structures. Second, the enhanced cell boundaries are detected by minimizing the Chan-Vese model in a fast level set-like framework. To allow simultaneous tracking of multiple cells over time, the contour evolution has been integrated with a topological prior exploiting the object indication function. Preliminary tracking experiments on 2D time-lapse series of GFP-transfected adipose-derived stem cells demonstrate high accuracy and short execution times.