J 2012

A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine deltaNp63-interacting partners

HERNYCHOVÁ, Lenka, Marta NEKULOVÁ, David POTĚŠIL, Eva MICHALOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL et. al.

Základní údaje

Originální název

A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine deltaNp63-interacting partners

Autoři

HERNYCHOVÁ, Lenka (203 Česká republika), Marta NEKULOVÁ (203 Česká republika), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Eva MICHALOVÁ (203 Česká republika), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Česká republika) a Jitka HOLČÁKOVÁ (203 Česká republika)

Vydání

Klinická onkologie, 2012, 0862-495X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14740/12:00073401

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova česky

protilátky; p63; imunoprecipitace; proteomika; hmotnostní spektrometrie; protein proteinové interakce

Klíčová slova anglicky

antibodies; p63; immunoprecipitation; proteomics; mass spectrometry; protein; protein interactions

Příznaky

Recenzováno
Změněno: 17. 4. 2015 10:43, Martina Prášilová

Anotace

V originále

Expression of p63 is essential for the formation of epidermis and other stratifying epitheliA. Moreover p63 is highly expressed in several epithelial cancers and is involved in tumourige­nesis and controlling chemosensitivity. The identification of p63 interacting partners is essential for understanding the complex network of gene regulation managing epithelial development and could also help to reveal signalling pathways participating in UV damage response in human skin. We used a proteomic approach to identify proteins that interact with deltaNp63. Proteins were isolated by immunoprecipitation with deltaNp63 specific antibody and analysed by mass spectrometry. We identified 23 proteins as potential deltaNp63 binding partners that were not present in negative control samples. These results will be evaluated using other methods.

Česky

Exprese p63 je nezbytná pro tvorbu epidermis a dalších vrstev epitelU.Je přítomen ve vysokých koncentracích v různých kožních nádorech, podílí se na rakovinném bujení a kontroluje chemosenzitivitu. Identifikace interakčních partnerů p63 je nezbytná pro pochopení celého systému genové regulace řídící vývoj epitelu. Tyto znalosti mohou také pomoci objasnit signální dráhy podílející se na odpovědi lidské kůže poškozené UV zářením. K identifikaci proteinů tvořících komplexy s deltaNp63 byly použity proteomické přístupy. Proteiny byly izolovány imunoprecipitací deltaNp63 specifickou protilátkou a následně analyzovány hmotnostní spektrometrií. Identifikovali jsme 23 proteinů, potenciálních interakčních partnerů deltaNp63, které nebyly nalezeny v kontrolních vzorcích. Získané výsledky budou ověřeny dalšími metodami.

Návaznosti

GBP206/12/G151, projekt VaV
Název: Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice