SEDLÁČEK, Ivo, Ondrej ŠEDO, Tereza GELBÍČOVÁ, Andrea VÁVROVÁ PASCUTTI, Eva KROUPOVÁ, Michaela SEDLÁČKOVÁ a Pavel ŠVEC. Characterization of Aeromonas popoffii isolates. In ICCC13. 2013.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Characterization of Aeromonas popoffii isolates
Autoři SEDLÁČEK, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, domácí), Tereza GELBÍČOVÁ (203 Česká republika, domácí), Andrea VÁVROVÁ PASCUTTI (203 Česká republika, domácí), Eva KROUPOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michaela SEDLÁČKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Pavel ŠVEC (203 Česká republika, domácí).
Vydání ICCC13, 2013.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/13:00069599
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky Aeromonas popoffii; MALDI-TOF MS; ribotyping; phenotyping
Změnil Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 09:46.
Anotace
Forty eight A. popoffii-like isolates from water sources (e.g. river freshwater, water pond, underground water and stream water) sampled in Czech Republic and Slovakia during 2008-2012, were characterized by PvuII ribotyping (using RiboPrinter identification system), extensive biochemical testing (tube and plate tests, ENTEROtest 24, Biolog system) and MALDI-TOF MS analysis along with reference strains of A. hydrophila group. These strains were tentatively identified as A. popoffii on the base of the negative sucrose acidification, which is a typical trait of this species. MALDI-TOF MS showed the highest discriminatory power for presumptive A. popoffii isolates and this method seems to be valuable for species identification of A. hydrophila group. RiboPrinter demonstrated great heterogeneity of ribotyping patterns among A. popoffii strains but their identification is impracticable due to the absence of A. popoffii reference patterns in the RiboPrinter identification database. Four presumptive A. popoffii isolates (P3282, P4293, P4571 and P4573) displayed very distinct riboprint profiles. Their further investigation using 16S rRNA and cpn60 genes sequencing assigned these strains as Aeromonas veronii and Aeromonas sobria species.
Návaznosti
EE2.3.20.0183, projekt VaVNázev: Centrum experimentální biomedicíny
VytisknoutZobrazeno: 4. 9. 2024 19:15