NIHARIKA, Neha, Hana MOSKALÍKOVÁ, Jasvinder KAUR, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Aleš HAMPL, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Rup LAL. Novosphingobium barchaimii sp nov., isolated from hexachlorocyclohexane-contaminated soil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2013, roč. 63, Part 2, s. 667-672. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.039826-0.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Novosphingobium barchaimii sp nov., isolated from hexachlorocyclohexane-contaminated soil
Autoři NIHARIKA, Neha (356 Indie), Hana MOSKALÍKOVÁ (203 Česká republika), Jasvinder KAUR (356 Indie), Miroslava SEDLÁČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Aleš HAMPL (203 Česká republika, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí), Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí) a Rup LAL (356 Indie).
Vydání International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2013, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.798
Kód RIV RIV/00216224:14310/13:00065825
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.039826-0
UT WoS 000317170400043
Klíčová slova anglicky IDENTIFICATION; MICROORGANISMS; SPHINGOMONAS; SPHINGOBIUM; ACID
Štítky AKR, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2014 15:33.
Anotace
A yellow pigmented bacterial strain, designated LL02T was isolated from HCH contaminated soil from Spolana, Neratovice former Czech producer of Lindane. A neighbour-joining tree based on 16S rRNA gene sequences showed that strain LL02T occupied a distinct phylogenetic position in the Novophingobium cluster, showing the highest similarity with Novosphingobium resinovorum NCIMB 8767T (98.59%). The DNA-DNA relatedness values of strain LL02T with its phylogenetic neighbours were found to be less than 70% indicating that strain LL02T represents a novel species of the genus Novosphingobium. The DNA G+C content of strain LL02T was 67.72 plus minus 0 %. The major respiratory quinone present was ubiquinone Q10. The polar lipid profile of the strain LL02T also corresponded to those reported for other Novosphingobium species (phosphatidylethanolamine, diphosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, phosphatidylglycerol, phosphatidylmonomethylethanolamine and sphingoglycolipids), thus supporting its identification as a member of the genus Novosphingobium.
Návaznosti
ED0001/01/01, projekt VaVNázev: CETOCOEN
GAP202/10/1435, projekt VaVNázev: Analýza a vizualizace proteinových struktur
Investor: Grantová agentura ČR, Analýza a vizualizace proteinových struktur
GA203/08/0114, projekt VaVNázev: Specifické iontové efekty pro proteiny v roztocích a podobné biologicky relevantní systémy.
Investor: Grantová agentura ČR, Specifické iontové efekty pro proteiny v roztocích a podobné biologicky relevantní systémy
IAA401630901, projekt VaVNázev: Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
Investor: Akademie věd ČR, Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami
VytisknoutZobrazeno: 30. 5. 2024 18:05