KOVÁČIK, Lubomír, Sami KEREÏCHE, Johanna HÖÖG, Pavel JŮDA, Pavel MATULA a Ivan RAŠKA. A simple Fourier filter for suppression of the missing wedge ray artefacts in single-axis electron tomographic reconstructions. Journal of Structural Biology. Academic Press, 2014, roč. 186, č. 1, s. 141-152. ISSN 1047-8477. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2014.02.004.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název A simple Fourier filter for suppression of the missing wedge ray artefacts in single-axis electron tomographic reconstructions
Autoři KOVÁČIK, Lubomír (203 Česká republika), Sami KEREÏCHE (250 Francie), Johanna HÖÖG (752 Švédsko), Pavel JŮDA (203 Česká republika), Pavel MATULA (203 Česká republika, garant, domácí) a Ivan RAŠKA (203 Česká republika).
Vydání Journal of Structural Biology, Academic Press, 2014, 1047-8477.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.231
Kód RIV RIV/00216224:14330/14:00073497
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2014.02.004
UT WoS 000334570200015
Klíčová slova anglicky Electron tomography; Missing wedge; Missing wedge artefacts; Single-axis tilting
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D., učo 2927. Změněno: 28. 4. 2015 13:32.
Anotace
he limited specimen tilting range that is typically available in electron tomography gives rise to a region in the Fourier space of the reconstructed object where experimental data are unavailable - the missing wedge. Since this region is sharply delimited from the area of available data, the reconstructed signal is typically hampered by convolution with its impulse response, which gives rise to the well-known missing wedge artefacts in 3D reconstructions. Despite the recent progress in the field of reconstruction and regularization techniques, the missing wedge artefacts remain untreated in most current reconstruction workflows in structural biology. Therefore we have designed a simple Fourier angular filter that effectively suppresses the ray artefacts in the single-axis tilting projection acquisition scheme, making single-axis tomographic reconstructions easier to interpret in particular at low signal-to-noise ratio in acquired projections. The proposed filter can be easily incorporated into current electron tomographic reconstruction schemes.
Návaznosti
GBP302/12/G157, projekt VaVNázev: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii
Investor: Grantová agentura ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii
VytisknoutZobrazeno: 6. 10. 2024 23:49