On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation
in Fluorescence Microscopy

D 2014

On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy

SVOBODA, David, Vladimír ULMAN, Luděk MATYSKA, Martin MAŠKA, Ján BELLA et. al.

Základní údaje

Originální název

On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy

Autoři

SVOBODA, David (203 Česká republika, garant, domácí), Vladimír ULMAN (203 Česká republika, domácí), Luděk MATYSKA (203 Česká republika, domácí), Martin MAŠKA (203 Česká republika, domácí), Ján BELLA (703 Slovensko, domácí) a Stanislav STEJSKAL (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Neuveden, 2014 IEEE International Conference on Image Processing, od s. 3944-3948, 5 s. 2014

Nakladatel

IEEE Signal Processing Society

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

paměťový nosič (CD, DVD, flash disk)

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14330/14:00073637

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-1-4799-5750-7

DOI

http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801

UT WoS

000370063604023

Klíčová slova anglicky

Simulation; Biomedical imaging; Fluorescence microscopy; Photobleaching; Uneven illumination

Štítky

CBIA, cbia-web, core_B, firank_A

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 3. 5. 2016 10:48, doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.

Anotace

V originále

The simulation plays an important role in biomedical image analysis as it can inherently provide large collections of image data with absolute ground truth. Compared to real image data typically annotated by some expert, the computer generated data still lacks the authenticity due to the simplifications of various natural phenomena. In this paper, we focus on simulating the photobleaching effect and the uneven illumination, being simplified or even omitted from the majority of present simulation toolkits, to considerably improve the authenticity of computer generated data.

Návaznosti

CZ.1.07/2.3.00/30.0030, interní kód MU

Název: Rozvoj lidských zdrojů pro oblast buněčné biologie

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Rozvoj lidských zdrojů pro oblast buněčné biologie, 2.3 Lidské zdroje ve výzkumu a vývoji

EE2.3.30.0009, projekt VaV

Název: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci

GA14-22461S, projekt VaV

Název: Vývoj a studium metod pro kvantifikaci živých buněk (Akronym: Live Cell Quantification)

Investor: Grantová agentura ČR, Development and Study of Methods for Live Cell Quantification

Citovat

SVOBODA, David, Vladimír ULMAN, Luděk MATYSKA, Martin MAŠKA, Ján BELLA a Stanislav STEJSKAL. On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy. In 2014 IEEE International Conference on Image Processing. Neuveden: IEEE Signal Processing Society, 2014, s. 3944-3948. ISBN 978-1-4799-5750-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801.

@inproceedings{1183286,
   author = {Svoboda, David and Ulman, Vladimír and Matyska, Luděk and Maška, Martin and Bella, Ján and Stejskal, Stanislav},
   address = {Neuveden},
   booktitle = {2014 IEEE International Conference on Image Processing},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801},
   keywords = {Simulation; Biomedical imaging; Fluorescence microscopy; Photobleaching; Uneven illumination},
   howpublished = {paměťový nosič},
   language = {eng},
   location = {Neuveden},
   isbn = {978-1-4799-5750-7},
   pages = {3944-3948},
   publisher = {IEEE Signal Processing Society},
   title = {On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy},
   url = {http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801},
   year = {2014}
}

TY  - JOUR
ID  - 1183286
AU  - Svoboda, David - Ulman, Vladimír - Matyska, Luděk - Maška, Martin - Bella, Ján - Stejskal, Stanislav
PY  - 2014
TI  - On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy
PB  - IEEE Signal Processing Society
CY  - Neuveden
SN  - 9781479957507
KW  - Simulation
KW  - Biomedical imaging
KW  - Fluorescence microscopy
KW  - Photobleaching
KW  - Uneven illumination
UR  - http://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801
N2  - The simulation plays an important role in biomedical image analysis as it can inherently provide large collections of image data with absolute ground truth. Compared to real image data typically annotated by some expert, the computer generated data still lacks the authenticity due to the simplifications of various natural phenomena. In this paper, we focus on simulating the photobleaching effect and the uneven illumination, being simplified or even omitted from the majority of present simulation toolkits, to considerably improve the authenticity of computer generated data.
ER  -

SVOBODA, David, Vladimír ULMAN, Luděk MATYSKA, Martin MAŠKA, Ján BELLA a Stanislav STEJSKAL. On Proper Simulation of Phenomena Influencing Image Formation in Fluorescence Microscopy. In \textit{2014 IEEE International Conference on Image Processing}. Neuveden: IEEE Signal Processing Society, 2014, s.~3944-3948. ISBN~978-1-4799-5750-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2014.7025801.

Podrobný výpis o publikaci