NOVOTNÝ, Jan, Yevgen YURENKO, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Tailoring the Properties of Quadruplex Nucleobases for Biological and Nanomaterial Applications. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 29, s. 15241-15248. ISSN 1463-9076. doi:10.1039/C4CP00541D.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Tailoring the Properties of Quadruplex Nucleobases for Biological and Nanomaterial Applications
Autoři NOVOTNÝ, Jan (203 Česká republika, domácí), Yevgen YURENKO (804 Ukrajina, domácí), Petr KULHÁNEK (203 Česká republika, domácí) a Radek MAREK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Physical Chemistry Chemical Physics, Cambridge, Royal Society of Chemistry, 2014, 1463-9076.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW DOI: 10.1039/C4CP00541D
Impakt faktor Impact factor: 4.493
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00075618
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1039/C4CP00541D
UT WoS 000339173700023
Klíčová slova anglicky Quadruplex; DNA; guanine; xanthine; 9-deaza-8-haloxanthine; density-functional theory; hydrogen-bonding; stacking; ion coordination; formation energy
Štítky kontrola MP, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 12. 2019 09:29.
Anotace
Guanine DNA quadruplexes are interesting and important biological objects because they represent potential targets for regulatory drugs. Their use as building blocks for biomaterial applications is also being investigated. This contribution reports the in silico design of artificial building blocks derived from xanthine. Methods of quantum chemistry were used to evaluate the properties of xanthine structures relative to those containing guanine, the natural reference used. Tailoring the xanthine core showed that the base stacking and the ion coordination were significantly enhanced in the designed systems, while the ion-transport properties were not affected. Our study suggests that the 9-deaza-8-haloxanthine bases (where the halogen is fluorine or chlorine) is highly promising candidate for the development of artificial quadruplexes and quadruplex-active ligands.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
VytisknoutZobrazeno: 28. 11. 2021 22:25