Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in
medulloblastoma

J 2014

Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma

NORTHCOTT, Paul A., Catherine LEE, Thomas ZICHNER, Adrian M. STÜTZ, Serap ERKEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma

Autoři

NORTHCOTT, Paul A. (276 Německo), Catherine LEE (840 Spojené státy), Thomas ZICHNER (276 Německo), Adrian M. STÜTZ (276 Německo), Serap ERKEK (276 Německo), Daisuke KAWAUCHI (276 Německo), David J.H. SHIH (124 Kanada), Volker HOVESTADT (276 Německo), Marc ZAPATKA (276 Německo), Dominik STURM (276 Německo), David T.W. JONES (276 Německo), Marcel KOOL (276 Německo), Marc REMKE (124 Kanada), Florence M.G. CAVALLI (124 Kanada), Scott ZUYDERDUYN (124 Kanada), Gary D. BADER (124 Kanada), Scott VANDENBERG (840 Spojené státy), Lourdes Adriana ESPARZA (840 Spojené státy), Marina RYZHOVA (643 Rusko), Wei WANG (276 Německo), Andrea WITTMANN (276 Německo), Sebastian STARK (276 Německo), Laura SIEBER (276 Německo), Huriye SEKER-CIN (276 Německo), Linda LINKE (203 Česká republika), Fabian KRATOCHWIL (276 Německo), Natalie JÄGER (276 Německo), Ivo BUCHHALTER (276 Německo), Charles D. IMBUSCH (276 Německo), Gideon ZIPPRICH (276 Německo), Benjamin RAEDER (276 Německo), Sabine SCHMIDT (276 Německo), Nicolle DIESSL (276 Německo), Stephan WOLF (276 Německo), Stefan WIEMANN (276 Německo), Benedikt BRORS (276 Německo), Chris LAWERENZ (276 Německo), Jürgen EILS (276 Německo), Hans-Jörg WARNATZ (276 Německo), Thomas RISCH (276 Německo), Marie-Laure YASPO (276 Německo), Ursula D. WEBER (276 Německo), Cynthia C. BARTHOLOMAE (276 Německo), Christof von KALLE (276 Německo), Eszter TURÁNYI (348 Maďarsko), Peter HAUSER (348 Maďarsko), Emma SANDEN (752 Švédsko), Anna DARABI (752 Švédsko), Peter SIESJÖ (752 Švédsko), Jaroslav ŠTĚRBA (203 Česká republika, garant, domácí), Karel ZITTERBART (203 Česká republika, domácí), David SUMERAUER (203 Česká republika), Peter van SLUIS (528 Nizozemské království), Rogier VERSTEEG (528 Nizozemské království), Richard VOLCKMANN (528 Nizozemské království), Jan KOSTER (528 Nizozemské království), Martin U. SCHUHMANN (276 Německo), Martin EBINGER (276 Německo), H. Leighton GRIMES (840 Spojené státy), Giles W. ROBINSON (840 Spojené státy), Amar GAJJAR (840 Spojené státy), Martin MYNAREK (276 Německo), Katja von HOFF (276 Německo), Stefan RUTKOWSKI (276 Německo), Torsten PIETSCH (276 Německo), Wolfram SCHEURLEN (276 Německo), Jörg FELSBERG (276 Německo), Guido REIFENBERGER (276 Německo), Andreas E. KULOZIK (276 Německo), Andreas von DEIMLING (276 Německo), Olaf WITT (276 Německo), Roland EILS (276 Německo), Richard J. GILBERTSON (276 Německo), Andrey KORSHUNOV (276 Německo), Michael D. TAYLOR (124 Kanada), Peter LICHTER (276 Německo), Jan O. KORBEL (826 Velká Británie a Severní Irsko), Robert J. WECHSLER-REYA (840 Spojené státy) a Stefan M. PFISTER (276 Německo)

Vydání

Nature, LONDON, NATURE PUBLISHING GROUP, 2014, 0028-0836

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 41.456

Kód RIV

RIV/00216224:14110/14:00076119

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1038/nature13379

UT WoS

000339335700038

Klíčová slova anglicky

ZINC-FINGER PROTEIN; T-CELL LYMPHOMAGENESIS; STEM-CELLS; SUPER-ENHANCERS; CANCER; MUTATIONS; GENOME; GENE; MYC; SUBGROUP

Štítky

EL OK

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 24. 4. 2015 13:13, Soňa Böhmová

Anotace

V originále

Medulloblastoma is a highly malignant paediatric brain tumour currently treated with a combination of surgery, radiation and chemotherapy, posing a considerable burden of toxicity to the developing child. Genomics has illuminated the extensive intertumoral heterogeneity of medulloblastoma, identifying four distinct molecular subgroups. Group 3 and group 4 subgroup medulloblastomas account for most paediatric cases; yet, oncogenic drivers for these subtypes remain largely unidentified. Here we describe a series of prevalent, highly disparate genomic structural variants, restricted to groups 3 and 4, resulting in specific and mutually exclusive activation of the growth factor independent 1 family proto-oncogenes, GFI1 and GFI1B. Somatic structural variants juxtapose GFI1 or GFI1B coding sequences proximal to active enhancer elements, including super-enhancers, instigating oncogenic activity. Our results, supported by evidence from mouse models, identify GFI1 and GFI1B as prominent medulloblastoma oncogenes and implicate 'enhancer hijacking' as an efficient mechanism driving oncogene activation in a childhood cancer.

Citovat

NORTHCOTT, Paul A., Catherine LEE, Thomas ZICHNER, Adrian M. STÜTZ, Serap ERKEK, Daisuke KAWAUCHI, David J.H. SHIH, Volker HOVESTADT, Marc ZAPATKA, Dominik STURM, David T.W. JONES, Marcel KOOL, Marc REMKE, Florence M.G. CAVALLI, Scott ZUYDERDUYN, Gary D. BADER, Scott VANDENBERG, Lourdes Adriana ESPARZA, Marina RYZHOVA, Wei WANG, Andrea WITTMANN, Sebastian STARK, Laura SIEBER, Huriye SEKER-CIN, Linda LINKE, Fabian KRATOCHWIL, Natalie JÄGER, Ivo BUCHHALTER, Charles D. IMBUSCH, Gideon ZIPPRICH, Benjamin RAEDER, Sabine SCHMIDT, Nicolle DIESSL, Stephan WOLF, Stefan WIEMANN, Benedikt BRORS, Chris LAWERENZ, Jürgen EILS, Hans-Jörg WARNATZ, Thomas RISCH, Marie-Laure YASPO, Ursula D. WEBER, Cynthia C. BARTHOLOMAE, Christof von KALLE, Eszter TURÁNYI, Peter HAUSER, Emma SANDEN, Anna DARABI, Peter SIESJÖ, Jaroslav ŠTĚRBA, Karel ZITTERBART, David SUMERAUER, Peter van SLUIS, Rogier VERSTEEG, Richard VOLCKMANN, Jan KOSTER, Martin U. SCHUHMANN, Martin EBINGER, H. Leighton GRIMES, Giles W. ROBINSON, Amar GAJJAR, Martin MYNAREK, Katja von HOFF, Stefan RUTKOWSKI, Torsten PIETSCH, Wolfram SCHEURLEN, Jörg FELSBERG, Guido REIFENBERGER, Andreas E. KULOZIK, Andreas von DEIMLING, Olaf WITT, Roland EILS, Richard J. GILBERTSON, Andrey KORSHUNOV, Michael D. TAYLOR, Peter LICHTER, Jan O. KORBEL, Robert J. WECHSLER-REYA a Stefan M. PFISTER. Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma. Nature. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2014, roč. 511, č. 7510, s. "428"-"+", 19 s. ISSN 0028-0836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/nature13379.

@article{1194769,
   author = {Northcott, Paul A. and Lee, Catherine and Zichner, Thomas and Stütz, Adrian M. and Erkek, Serap and Kawauchi, Daisuke and Shih, David J.H. and Hovestadt, Volker and Zapatka, Marc and Sturm, Dominik and Jones, David T.W. and Kool, Marcel and Remke, Marc and Cavalli, Florence M.G. and Zuyderduyn, Scott and Bader, Gary D. and VandenBerg, Scott and Esparza, Lourdes Adriana and Ryzhova, Marina and Wang, Wei and Wittmann, Andrea and Stark, Sebastian and Sieber, Laura and SekerandCin, Huriye and Linke, Linda and Kratochwil, Fabian and Jäger, Natalie and Buchhalter, Ivo and Imbusch, Charles D. and Zipprich, Gideon and Raeder, Benjamin and Schmidt, Sabine and Diessl, Nicolle and Wolf, Stephan and Wiemann, Stefan and Brors, Benedikt and Lawerenz, Chris and Eils, Jürgen and Warnatz, HansandJörg and Risch, Thomas and Yaspo, MarieandLaure and Weber, Ursula D. and Bartholomae, Cynthia C. and Kalle, Christof von and Turányi, Eszter and Hauser, Peter and Sanden, Emma and Darabi, Anna and Siesjö, Peter and Štěrba, Jaroslav and Zitterbart, Karel and Sumerauer, David and Sluis, Peter van and Versteeg, Rogier and Volckmann, Richard and Koster, Jan and Schuhmann, Martin U. and Ebinger, Martin and Grimes, H. Leighton and Robinson, Giles W. and Gajjar, Amar and Mynarek, Martin and Hoff, Katja von and Rutkowski, Stefan and Pietsch, Torsten and Scheurlen, Wolfram and Felsberg, Jörg and Reifenberger, Guido and Kulozik, Andreas E. and Deimling, Andreas von and Witt, Olaf and Eils, Roland and Gilbertson, Richard J. and Korshunov, Andrey and Taylor, Michael D. and Lichter, Peter and Korbel, Jan O. and WechslerandReya, Robert J. and Pfister, Stefan M.},
   article_location = {LONDON},
   article_number = {7510},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1038/nature13379},
   keywords = {ZINC-FINGER PROTEIN; T-CELL LYMPHOMAGENESIS; STEM-CELLS; SUPER-ENHANCERS; CANCER; MUTATIONS; GENOME; GENE; MYC; SUBGROUP},
   language = {eng},
   issn = {0028-0836},
   journal = {Nature},
   title = {Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma},
   volume = {511},
   year = {2014}
}

TY  - JOUR
ID  - 1194769
AU  - Northcott, Paul A. - Lee, Catherine - Zichner, Thomas - Stütz, Adrian M. - Erkek, Serap - Kawauchi, Daisuke - Shih, David J.H. - Hovestadt, Volker - Zapatka, Marc - Sturm, Dominik - Jones, David T.W. - Kool, Marcel - Remke, Marc - Cavalli, Florence M.G. - Zuyderduyn, Scott - Bader, Gary D. - VandenBerg, Scott - Esparza, Lourdes Adriana - Ryzhova, Marina - Wang, Wei - Wittmann, Andrea - Stark, Sebastian - Sieber, Laura - Seker-Cin, Huriye - Linke, Linda - Kratochwil, Fabian - Jäger, Natalie - Buchhalter, Ivo - Imbusch, Charles D. - Zipprich, Gideon - Raeder, Benjamin - Schmidt, Sabine - Diessl, Nicolle - Wolf, Stephan - Wiemann, Stefan - Brors, Benedikt - Lawerenz, Chris - Eils, Jürgen - Warnatz, Hans-Jörg - Risch, Thomas - Yaspo, Marie-Laure - Weber, Ursula D. - Bartholomae, Cynthia C. - Kalle, Christof von - Turányi, Eszter - Hauser, Peter - Sanden, Emma - Darabi, Anna - Siesjö, Peter - Štěrba, Jaroslav - Zitterbart, Karel - Sumerauer, David - Sluis, Peter van - Versteeg, Rogier - Volckmann, Richard - Koster, Jan - Schuhmann, Martin U. - Ebinger, Martin - Grimes, H. Leighton - Robinson, Giles W. - Gajjar, Amar - Mynarek, Martin - Hoff, Katja von - Rutkowski, Stefan - Pietsch, Torsten - Scheurlen, Wolfram - Felsberg, Jörg - Reifenberger, Guido - Kulozik, Andreas E. - Deimling, Andreas von - Witt, Olaf - Eils, Roland - Gilbertson, Richard J. - Korshunov, Andrey - Taylor, Michael D. - Lichter, Peter - Korbel, Jan O. - Wechsler-Reya, Robert J. - Pfister, Stefan M.
PY  - 2014
TI  - Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma
JF  - Nature
VL  - 511
IS  - 7510
SP  - "428"-"+"
EP  - "428"-"+"
PB  - NATURE PUBLISHING GROUP
SN  - 00280836
KW  - ZINC-FINGER PROTEIN
KW  - T-CELL LYMPHOMAGENESIS
KW  - STEM-CELLS
KW  - SUPER-ENHANCERS
KW  - CANCER
KW  - MUTATIONS
KW  - GENOME
KW  - GENE
KW  - MYC
KW  - SUBGROUP
N2  - Medulloblastoma is a highly malignant paediatric brain tumour currently treated with a combination of surgery, radiation and chemotherapy, posing a considerable burden of toxicity to the developing child. Genomics has illuminated the extensive intertumoral heterogeneity of medulloblastoma, identifying four distinct molecular subgroups. Group 3 and group 4 subgroup medulloblastomas account for most paediatric cases; yet, oncogenic drivers for these subtypes remain largely unidentified. Here we describe a series of prevalent, highly disparate genomic structural variants, restricted to groups 3 and 4, resulting in specific and mutually exclusive activation of the growth factor independent 1 family proto-oncogenes, GFI1 and GFI1B. Somatic structural variants juxtapose GFI1 or GFI1B coding sequences proximal to active enhancer elements, including super-enhancers, instigating oncogenic activity. Our results, supported by evidence from mouse models, identify GFI1 and GFI1B as prominent medulloblastoma oncogenes and implicate 'enhancer hijacking' as an efficient mechanism driving oncogene activation in a childhood cancer.
ER  -

NORTHCOTT, Paul A., Catherine LEE, Thomas ZICHNER, Adrian M. STÜTZ, Serap ERKEK, Daisuke KAWAUCHI, David J.H. SHIH, Volker HOVESTADT, Marc ZAPATKA, Dominik STURM, David T.W. JONES, Marcel KOOL, Marc REMKE, Florence M.G. CAVALLI, Scott ZUYDERDUYN, Gary D. BADER, Scott VANDENBERG, Lourdes Adriana ESPARZA, Marina RYZHOVA, Wei WANG, Andrea WITTMANN, Sebastian STARK, Laura SIEBER, Huriye SEKER-CIN, Linda LINKE, Fabian KRATOCHWIL, Natalie JÄGER, Ivo BUCHHALTER, Charles D. IMBUSCH, Gideon ZIPPRICH, Benjamin RAEDER, Sabine SCHMIDT, Nicolle DIESSL, Stephan WOLF, Stefan WIEMANN, Benedikt BRORS, Chris LAWERENZ, Jürgen EILS, Hans-Jörg WARNATZ, Thomas RISCH, Marie-Laure YASPO, Ursula D. WEBER, Cynthia C. BARTHOLOMAE, Christof von KALLE, Eszter TURÁNYI, Peter HAUSER, Emma SANDEN, Anna DARABI, Peter SIESJÖ, Jaroslav ŠTĚRBA, Karel ZITTERBART, David SUMERAUER, Peter van SLUIS, Rogier VERSTEEG, Richard VOLCKMANN, Jan KOSTER, Martin U. SCHUHMANN, Martin EBINGER, H. Leighton GRIMES, Giles W. ROBINSON, Amar GAJJAR, Martin MYNAREK, Katja von HOFF, Stefan RUTKOWSKI, Torsten PIETSCH, Wolfram SCHEURLEN, Jörg FELSBERG, Guido REIFENBERGER, Andreas E. KULOZIK, Andreas von DEIMLING, Olaf WITT, Roland EILS, Richard J. GILBERTSON, Andrey KORSHUNOV, Michael D. TAYLOR, Peter LICHTER, Jan O. KORBEL, Robert J. WECHSLER-REYA a Stefan M. PFISTER. Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma. \textit{Nature}. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2014, roč.~511, č.~7510, s.~''428''-''+'', 19 s. ISSN~0028-0836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/nature13379.

Podrobný výpis o publikaci