CHALOUPKOVÁ, Radka, T. PRUDNIKOVA, P. REZACOVA, Zbyněk PROKOP, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Lukáš DANIEL, Jan BREZOVSKÝ, W. IKEDA-OHTSUBO, Y. SATO, M. KUTY, Y. NAGATA, I. KUTA SMATANOVA a Jiří DAMBORSKÝ. Structural and Functional Analysis of a Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites. Acta Crystallographica D. 2014, roč. 70, July, s. 1884-1897. ISSN 0907-4449. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S1399004714009018.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Structural and Functional Analysis of a Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites.
Autoři CHALOUPKOVÁ, Radka (203 Česká republika, domácí), T. PRUDNIKOVA (112 Bělorusko), P. REZACOVA (203 Česká republika), Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí), Táňa KOUDELÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lukáš DANIEL (203 Česká republika, domácí), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí), W. IKEDA-OHTSUBO (392 Japonsko), Y. SATO (392 Japonsko), M. KUTY (203 Česká republika), Y. NAGATA (392 Japonsko), I. KUTA SMATANOVA (203 Česká republika) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Acta Crystallographica D, 2014, 0907-4449.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 7.232 v roce 2013
Kód RIV RIV/00216224:14310/14:00074206
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1107/S1399004714009018
UT WoS 000338917000009
Klíčová slova anglicky haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkanii USDA94
Štítky AKR, rivok
Změnil Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 11. 4. 2015 15:07.
Anotace
Crystal structure of novel haloalkane dehalogenase DbeA revealed the presence of two chloride ions buried in the protein interior. The first halide-binding site is involved in substrate binding and is present in all structurally characterized haloalkane dehalogenases. The second halide-binding site is unique to DbeA. To elucidate the role of the second halide-binding site in enzyme functionality, a two-point mutant lacking this site was constructed and characterized. These substitutions resulted in a shift of substrate-specificity class and were accompanied by decrease of enzyme activity, stability and elimination of the substrate inhibition. The changes in enzyme catalytic activity were attributed to deceleration of the rate-limiting hydrolytic step, mediated by lower basicity of the catalytic histidine.
Návaznosti
GAP207/12/0775, projekt VaVNázev: Strukturně-funkční vztahy haloalkan dehalogenas
Investor: Grantová agentura ČR, Structure-functional Relationships of Haloalkane Dehalogenases
LO1214, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
VytisknoutZobrazeno: 31. 5. 2024 05:14