SYKORA, J., Jan BREZOVSKÝ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, M. LAHODA, Andrea FOŘTOVÁ, T. CHERNOVETS, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zbyněk PROKOP, I. KUTA SMATANOVA, M. HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design. Nature Chemical Biology. 2014, roč. 10, č. 6, s. 428-430. ISSN 1552-4450.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design.
Autoři SYKORA, J. (203 Česká republika), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí), Táňa KOUDELÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), M. LAHODA (112 Bělorusko), Andrea FOŘTOVÁ (203 Česká republika, domácí), T. CHERNOVETS (112 Bělorusko), Radka CHALOUPKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Zbyněk PROKOP (203 Česká republika, domácí), I. KUTA SMATANOVA (203 Česká republika), M. HOF (276 Německo) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Nature Chemical Biology, 2014, 1552-4450.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 12.996
Kód RIV RIV/00216224:14310/14:00074209
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000336238200008
Klíčová slova anglicky haloalkane dehalogenase
Štítky AKR, rivok
Změnil Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:04.
Anotace
We emphasize the importance of dynamics and hydration for enzymatic catalysis and protein design by transplanting the active site from a haloalkane dehalogenase with high enantioselectivity to nonselective dehalogenase. Protein crystallography confirms that the active site geometry of the redesigned dehalogenase matches that of the target, but its enantioselectivity remains low. Time-dependent fluorescence shifts and computer simulations revealed that dynamics and hydration at the tunnel mouth differ substantially between the redesigned and target dehalogenase.
Návaznosti
EE2.3.30.0037, projekt VaVNázev: Zaměstnáním nejlepších mladých vědců k rozvoji mezinárodní spolupráce
GAP503/12/0572, projekt VaVNázev: Konstrukce syntetické metabolické dráhy pro degradaci důležitého environmentálního polutantu proteinovým a metabolickým inženýrstvím
Investor: Grantová agentura ČR, Konstrukce syntetické metabolické dráhy pro degradaci důležitého environmentlního polutantu proteinovým a metabolickým inženýrstvím
LO1214, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
VytisknoutZobrazeno: 30. 5. 2024 21:18