R 2014

ValidatorDB: database of validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Deepti JAISWAL, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL et. al.

Základní údaje

Originální název

ValidatorDB: database of validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

Autoři

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka (203 Česká republika, domácí), Deepti JAISWAL (356 Indie, domácí), David SEHNAL (203 Česká republika, domácí), Crina-Maria IONESCU (642 Rumunsko, domácí), Stanislav GEIDL (203 Česká republika, domácí), Lukáš PRAVDA (203 Česká republika, domácí), Vladimír HORSKÝ (203 Česká republika, domácí), Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, domácí) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

2014

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14740/14:00077887

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova anglicky

PROTEIN DATA-BANK; CRYSTAL-STRUCTURES; CRYSTALLOGRAPHY; INFORMATION; REFINEMENT; BIOLOGY; ARCHIVE; SERVER

Technické parametry

Validace se provádí proti modelům z wwPDB CCD, nejsou zahrnuty standardní aminokyseliny a nukleotidy. Kontaktní osoba: RNDr. David Sehnal, david.sehnal@mail.muni.cz

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 8. 7. 2015 13:56, Olga Křížová

Anotace

V originále

Validation performed against models from wwPDB Chemical Component Dictionary (wwPDB CCD). The molecules deemed relevant for validation are all ligands and non-standard residues with reasonable size (more than six heavy atoms).

Návaznosti

LH13055, projekt VaV
Název: Multidisciplinární přístup k návrhu léčiv - Inhibice proteinů s návazností na cukry (Akronym: MADICA)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Multidisciplinární přístup k návrhu léčiv - Inhibice proteinů s návazností na sacharidy