Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman
Spectroscopy

J 2014

Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy

SAMEK, Ota, Katarína MLYNÁRIKOVÁ, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Vladislav KRZYŽÁNEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy

Autoři

SAMEK, Ota (203 Česká republika), Katarína MLYNÁRIKOVÁ (703 Slovensko, domácí), Silvie BERNATOVÁ (203 Česká republika), Jan JEŽEK (203 Česká republika), Vladislav KRZYŽÁNEK (203 Česká republika), Martin ŠILER (203 Česká republika), Pavel ZEMÁNEK (203 Česká republika), Filip RŮŽIČKA (203 Česká republika, garant, domácí), Veronika HOLÁ (203 Česká republika, domácí) a Martina MAHELOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

International Journal of Molecular Sciences, Basel, Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2014, 1422-0067

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.862

Kód RIV

RIV/00216224:14110/14:00074351

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.3390/ijms151223924

UT WoS

000346797400133

Klíčová slova anglicky

Raman spectroscopy; Candida parapsilosis; biofilm

Štítky

EL OK

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 6. 5. 2016 14:26, Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková

Anotace

V originále

Colonies of Candida parapsilosis on culture plates were probed directly in situ using Raman spectroscopy for rapid identification of specific strains separated by a given time intervals (up to months apart). To classify the Raman spectra, data analysis was performed using the approach of principal component analysis (PCA). The analysis of the data sets generated during the scans of individual colonies reveals that despite the inhomogeneity of the biological samples unambiguous associations to individual strains (two biofilm-positive and two biofilm-negative) could be made.

Návaznosti

GAP205/11/1687, projekt VaV

Název: Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace

Investor: Grantová agentura ČR, Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace

NT13242, projekt VaV

Název: Polymikrobiální biofilm jako příčina chronických močových infekcí a selhávání terapie: kultivační a PCR-DGGE diagnostika, význam a možnosti řešení

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Polymikrobiální biofilm jako příčina chronických močových infekcí a selhávání terapie: kultivační a PCR-DGGE diagnostika, význam a možnosti řešení

Citovat

SAMEK, Ota, Katarína MLYNÁRIKOVÁ, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Vladislav KRZYŽÁNEK, Martin ŠILER, Pavel ZEMÁNEK, Filip RŮŽIČKA, Veronika HOLÁ a Martina MAHELOVÁ. Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2014, roč. 15, č. 12, s. 23924-23935. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms151223924.

@article{1217911,
   author = {Samek, Ota and Mlynáriková, Katarína and Bernatová, Silvie and Ježek, Jan and Krzyžánek, Vladislav and Šiler, Martin and Zemánek, Pavel and Růžička, Filip and Holá, Veronika and Mahelová, Martina},
   article_location = {Basel},
   article_number = {12},
   doi = {http://dx.doi.org/10.3390/ijms151223924},
   keywords = {Raman spectroscopy; Candida parapsilosis; biofilm},
   language = {eng},
   issn = {1422-0067},
   journal = {International Journal of Molecular Sciences},
   title = {Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy},
   volume = {15},
   year = {2014}
}

TY  - JOUR
ID  - 1217911
AU  - Samek, Ota - Mlynáriková, Katarína - Bernatová, Silvie - Ježek, Jan - Krzyžánek, Vladislav - Šiler, Martin - Zemánek, Pavel - Růžička, Filip - Holá, Veronika - Mahelová, Martina
PY  - 2014
TI  - Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy
JF  - International Journal of Molecular Sciences
VL  - 15
IS  - 12
SP  - 23924-23935
EP  - 23924-23935
PB  - Multidisciplinary Digital Publishing Institute
SN  - 14220067
KW  - Raman spectroscopy
KW  - Candida parapsilosis
KW  - biofilm
N2  - Colonies of Candida parapsilosis on culture plates were probed directly in situ using Raman spectroscopy for rapid identification of specific strains separated by a given time intervals (up to months apart). To classify the Raman spectra, data analysis was performed using the approach of principal component analysis (PCA). The analysis of the data sets generated during the scans of individual colonies reveals that despite the inhomogeneity of the biological samples unambiguous associations to individual strains (two biofilm-positive and two biofilm-negative) could be made.
ER  -

SAMEK, Ota, Katarína MLYNÁRIKOVÁ, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Vladislav KRZYŽÁNEK, Martin ŠILER, Pavel ZEMÁNEK, Filip RŮŽIČKA, Veronika HOLÁ a Martina MAHELOVÁ. Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy. \textit{International Journal of Molecular Sciences}. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2014, roč.~15, č.~12, s.~23924-23935. ISSN~1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms151223924.

Podrobný výpis o publikaci