J 2014

Chromatin features of plant telomeric sequences at terminal vs. internal positions

MAJEROVÁ, Eva, Terezie MANDÁKOVÁ, GTH VU, Jiří FAJKUS, Martin LYSÁK et. al.

Základní údaje

Originální název

Chromatin features of plant telomeric sequences at terminal vs. internal positions

Autoři

MAJEROVÁ, Eva (203 Česká republika, domácí), Terezie MANDÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), GTH VU (276 Německo), Jiří FAJKUS (203 Česká republika, garant, domácí), Martin LYSÁK (203 Česká republika, domácí) a Miloslava FOJTOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Frontiers in Plant Science, LAUSANNE, Frontiers Research Foundation, 2014, 1664-462X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10611 Plant sciences, botany

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 3.948

Kód RIV

RIV/00216224:14740/14:00074402

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

UT WoS

000346855100002

Klíčová slova anglicky

telomere; chromatin; epigenetics; Nicotiana tabacum; Ballantinia antipoda; histone modifications; DNA methylation

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 10. 12. 2019 09:57, Mgr. Marie Šípková, DiS.

Anotace

V originále

Epigenetic mechanisms are involved in regulation of crucial cellular processes in eukaryotic organisms. Data on the epigenetic features of plant telomeres and their epigenetic regulation were published mostly for Arabidopsis thaliana, in which the presence of interstitial telomeric repeats (ITRs) may interfere with genuine telomeres in most analyses. Here, we studied the epigenetic landscape and transcription of telomeres and ITRs in Nicotiana tabacum with long telomeres and no detectable ITRs, and in Ballantinia antipoda with large blocks of pericentromeric ITRs and relatively short telomeres. Chromatin of genuine telomeres displayed heterochromatic as well as euchromatic marks, while ITRs were just heterochromatic. Methylated cytosines were present at telomeres and ITRs, but showed a bias with more methylation toward distal telomere positions and different blocks of B. antipoda ITRs methylated to different levels. Telomeric transcripts TERRA (G-rich) and ARRET (C-rich) were identified in both plants and their levels varied among tissues with a maximum in blossoms. Plants with substantially different proportions of internally and terminally located telomeric repeats are instrumental in clarifying the chromatin status of telomeric repeats at distinct chromosome locations.

Návaznosti

ED1.1.00/02.0068, projekt VaV
Název: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0189, projekt VaV
Název: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace
EE2.3.30.0037, projekt VaV
Název: Zaměstnáním nejlepších mladých vědců k rozvoji mezinárodní spolupráce
GAP501/11/0596, projekt VaV
Název: Epigenetické mechanismy regulace rostlinných telomer (Akronym: epigenetika telomer)
Investor: Grantová agentura ČR, Epigenetické mechanismy regulace rostlinných telomer