SMET, Annemieke, Piet COOLS, Lenka KŘÍŽOVÁ, Martina MAIXNEROVÁ, Ondrej ŠEDO, Freddy HAESEBROUCK, Marie KEMPF, Alexandr NEMEC a Mario VANEECHOUTTE. Acinetobacter gandensis sp nov isolated from horse and cattle. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Berks (England): Soc General Microbiology, 2014, roč. 64, December, s. 4007-4015. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.068791-0.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Acinetobacter gandensis sp nov isolated from horse and cattle
Autoři SMET, Annemieke (56 Belgie), Piet COOLS (56 Belgie), Lenka KŘÍŽOVÁ (203 Česká republika), Martina MAIXNEROVÁ (203 Česká republika), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, garant, domácí), Freddy HAESEBROUCK (56 Belgie), Marie KEMPF (250 Francie), Alexandr NEMEC (203 Česká republika) a Mario VANEECHOUTTE (56 Belgie).
Vydání International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Berks (England), Soc General Microbiology, 2014, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.511
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00074419
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.068791-0
UT WoS 000348622000014
Klíčová slova anglicky Acinetobacter gandensis; taxonomy; rpoB; 16S rRNA gene; MALDI-TOF MS
Štítky kontrola MP, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 11. 3. 2015 12:36.
Anotace
We previously reported the presence of an OXA-23 carbapenemase in an undescribed species of the genus Acinetobacter isolated from horse dung at the Faculty of Veterinary Medicine, Ghent University, Belgium. Here we include six strains to corroborate the delineation of this taxon by phenotypic characterization, DNA-DNA hybridization, 16S rRNA gene and rpoB sequence analysis, % G+C determination, MALDI-TOF MS and fatty acid analysis. The nearly complete 16S rRNA gene sequence of strain UG 60467(T) showed the highest similarities with those of the type strains of Acinetobacter bouvetii (98.4%), Acinetobacter haemolyticus (97.7%), and Acinetobacter schindleri (97.2%). The partial rpoB sequence of strain UG 60467(T) showed the highest similarities with 'Acinetobacter bohemicus' ANC 3994 (88.6%), A. bouvetii NIPH 2281 (88.6%) and A. schindleri CIP 1072871 (87.3%). Whole-cell MALDI-TOF MS analyses supported the distinctness of the group at the protein level. The predominant fatty acids of strain UG 60467(T) were C-12:0 3-OH, C-12:0, C-16:0, C-18:1 omega 9c and summed feature 3 (C-16:1 omega 7c and/or iso-C-15:0 2-OH). Strains UG 60467(T) and UG 60716 showed a DNA-DNA relatedness of 84% with each other and a DNA-DNA relatedness with A. schindleri LMG 19576(T) of 17 % and 20%, respectively. The DNA G C content of strain UG 60467(T) was 39.6 molok. The name Acinetobacter gandensis sp. nov. is proposed for the novel taxon. The type strain is UG 60467(T) (=ANC 4275(T)=LMG 27960(T)=DSM 28097(T)).
Návaznosti
GA13-26693S, projekt VaVNázev: Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.
Investor: Grantová agentura ČR, Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech
VytisknoutZobrazeno: 28. 8. 2024 05:27