Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

ŘEPKOVÁ, Jana, Jan IŠTVÁNEK, Jana DLUHOŠOVÁ, Jan NEDĚLNÍK and Hana JAKEŠOVÁ. Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního (Identification of gene specific microsatellite markers in red clover). 2014.

Basic information

• Original name: Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního
• Name in Czech: Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního
• Name (in English): Identification of gene specific microsatellite markers in red clover
• Authors: ŘEPKOVÁ, Jana (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Jan IŠTVÁNEK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana DLUHOŠOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan NEDĚLNÍK (203 Czech Republic) and Hana JAKEŠOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: 2014.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Cert., accred., approved methodology, spec. maps, medical, hist. methods
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/14:00073263
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords (in Czech): SSR marker; oligonukleoid; kódující sekvence; jetel luční; šlechtění
• Keywords in English: SSR marker; oligonucleoid; coding sequences; red clover; breeding
• Technical parameters: ESSENCE LINE, s.r.o. Plzeňská 130/221, Praha 5 IČO 26505142 zastoupený Ing. Petrem Novotným, jednatelem, podpis smlouvy 13.11.2014
• Tags: AKR, rivok
• Tags: Reviewed

Abstract

Metodický postup a řešení se týká navržení sady mikrosatelitních markerů ve specifických genech Trifolium pratense (jetel luční) definovaných na základě vlastního sekvenování další generace. Zahrnuje druhově specifické SSR markery v kódujících sekvencích (exonech) genů pro desaturázy, polyfenoloxidázy a noduliny, které jsou součástí metabolických drah biosyntézy mastných kyselin, důležitých pro kvalitu bílkovin a pro fixaci dusíku, a dále zahrnuje SSR markery v genech pro rezistenci a pro výnosové charakteristiky. Metodika se také vztahuje k postupu amplifikace cílových sekvencí SSR markerů pomocí specifických sond. Testovací sada mikrosatelitních markerů je určena pro oblast šlechtění jetele lučního.

Abstract (in English)

Method and procedure concern set of microsatellite markers in specific genes of Trifolium pratense (red clover) based on our own next generation sequencing. The set includs species specific SSR markers in coding sequences (exons) for desaturases, polyphenol oxidases and nodulins participating in biosynthesis of fatty acids, proteine quality and nitrogen fixation, in addition of markers in genes for resistance and yield. Methods includ specific oligonucleotides and amplification cycles of targeted SSR markes. The marker set has been intended for red clover breeding.

Links

• QI111A019, research and development project: Name: Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností (Acronym: HJ2010)

Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Sustainable development of agrarian sector