Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring
in human clinical material

J 2015

Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material

ŠVEC, Pavel, Annelies DE BEL, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Tereza GELBÍČOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material

Autoři

ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Annelies DE BEL (56 Belgie), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Petr PETRÁŠ (203 Česká republika), Tereza GELBÍČOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jitka ČERNOHLÁVKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivana MAŠLAŇOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivana VARBANOVOVÁ (203 Česká republika), Margo CNOCKAERT (56 Belgie), Fedoua ECHAHIDI (56 Belgie), Peter VANDAMME (56 Belgie) a Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, domácí)

Vydání

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, London, UK, Society for General Microbiology, 2015, 1466-5026

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 2.439

Kód RIV

RIV/00216224:14310/15:00080939

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000220

UT WoS

000360873600008

Klíčová slova anglicky

coagulase-negative staphylococci; Staphylococcus petrasii subsp. pragensis; rep-PCR; molecular phylogeny; MALDI-TOF mass spectrometry; fatty acid methyl ester analysis; DNA-DNA hybridization; automated ribotyping

Štítky

AKR, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 27. 2. 2019 11:47, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

V originále

Seven coagulase-negative, oxidase-negative and novobiocin-susceptible staphylococci assigned tentatively as Staphylococcus petrasii were investigated in this study in order to elucidate their taxonomic position. All strains were initially shown to form a genetically homogeneous group separated from remaining species of the genus Staphylococcus by using a repetitive sequence-based PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene, hsp60, rpoB, dnaJ, gap and tuf sequences showed that the group is closely related to Staphylococcus petrasii but separated from the three hitherto known subspecies, S. petrasii subsp. petrasii, S. petrasii subsp. croceilyticus and S. petrasii subsp. jettensis. Further investigation using automated ribotyping, MALDI-TOF mass spectrometry, fatty acid methyl ester analysis, DNA–DNA hybridization and extensive biotyping confirmed that the analysed group represents a novel subspecies within S. petrasii, for which the name Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov. is proposed. The type strain is NRL/St 12/356T (=CCM 8529T=LMG 28327T).

Návaznosti

EE2.3.20.0183, projekt VaV

Název: Centrum experimentální biomedicíny

EE2.4.31.0155, projekt VaV

Název: Partnerství a sítě pro spolupráci v experimentální biologii

GP13-05069P, projekt VaV

Název: Horizontální přenos stafylokokové chromozomové kazety mec (SCCmec) prostřednictvím bakteriofágů napříč kmeny rodu Staphylococcus

Investor: Grantová agentura ČR, Horizontální přenos stafylokokové chromozomové kazety mec (SCCmec) prostřednictvím bakteriofágů napříč kmeny rodu Staphylococcus

Přiložené soubory

2071_ijs000220.pdf

Požádat o autorskou verzi souboru

Citovat

ŠVEC, Pavel, Annelies DE BEL, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Tereza GELBÍČOVÁ, Jitka ČERNOHLÁVKOVÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Ivana VARBANOVOVÁ, Margo CNOCKAERT, Fedoua ECHAHIDI, Peter VANDAMME a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. London, UK: Society for General Microbiology, 2015, roč. 65, July, s. 2071-2077. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000220.

@article{1307096,
   author = {Švec, Pavel and De Bel, Annelies and Sedláček, Ivo and Petráš, Petr and Gelbíčová, Tereza and Černohlávková, Jitka and Mašlaňová, Ivana and Varbanovová, Ivana and Cnockaert, Margo and Echahidi, Fedoua and Vandamme, Peter and Pantůček, Roman},
   article_location = {London, UK},
   article_number = {July},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000220},
   keywords = {coagulase-negative staphylococci; Staphylococcus petrasii subsp. pragensis; rep-PCR; molecular phylogeny; MALDI-TOF mass spectrometry; fatty acid methyl ester analysis; DNA-DNA hybridization; automated ribotyping},
   language = {eng},
   issn = {1466-5026},
   journal = {International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology},
   title = {Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material},
   url = {http://ijs.sgmjournals.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.000220},
   volume = {65},
   year = {2015}
}

TY  - JOUR
ID  - 1307096
AU  - Švec, Pavel - De Bel, Annelies - Sedláček, Ivo - Petráš, Petr - Gelbíčová, Tereza - Černohlávková, Jitka - Mašlaňová, Ivana - Varbanovová, Ivana - Cnockaert, Margo - Echahidi, Fedoua - Vandamme, Peter - Pantůček, Roman
PY  - 2015
TI  - Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material
JF  - International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
VL  - 65
IS  - July
SP  - 2071-2077
EP  - 2071-2077
PB  - Society for General Microbiology
SN  - 14665026
KW  - coagulase-negative staphylococci
KW  - Staphylococcus petrasii subsp. pragensis
KW  - rep-PCR
KW  - molecular phylogeny
KW  - MALDI-TOF mass spectrometry
KW  - fatty acid methyl ester analysis
KW  - DNA-DNA hybridization
KW  - automated ribotyping
UR  - http://ijs.sgmjournals.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.000220
L2  - http://ijs.sgmjournals.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.000220
N2  - Seven coagulase-negative, oxidase-negative and novobiocin-susceptible staphylococci assigned tentatively as Staphylococcus petrasii were investigated in this study in order to elucidate their taxonomic position. All strains were initially shown to form a genetically homogeneous group separated from remaining species of the genus Staphylococcus by using a repetitive sequence-based PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene, hsp60, rpoB, dnaJ, gap and tuf sequences showed that the group is closely related to Staphylococcus petrasii but separated from the three hitherto known subspecies, S. petrasii subsp. petrasii, S. petrasii subsp. croceilyticus and S. petrasii subsp. jettensis. Further investigation using automated ribotyping, MALDI-TOF mass spectrometry, fatty acid methyl ester analysis, DNA–DNA hybridization and extensive biotyping confirmed that the analysed group represents a novel subspecies within S. petrasii, for which the name Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov. is proposed. The type strain is NRL/St 12/356T (=CCM 8529T=LMG 28327T).
ER  -

ŠVEC, Pavel, Annelies DE BEL, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Tereza GELBÍČOVÁ, Jitka ČERNOHLÁVKOVÁ, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Ivana VARBANOVOVÁ, Margo CNOCKAERT, Fedoua ECHAHIDI, Peter VANDAMME a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov., occurring in human clinical material. \textit{International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology}. London, UK: Society for General Microbiology, 2015, roč.~65, July, s.~2071-2077. ISSN~1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000220.

Podrobný výpis o publikaci