Identification of individual biofilm-forming bacterial cells
using Raman tweezers

J 2015

Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers

SAMEK, Ota, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Martin ŠILER, Mojmir ŠERÝ et. al.

Základní údaje

Originální název

Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers

Autoři

SAMEK, Ota (203 Česká republika), Silvie BERNATOVÁ (203 Česká republika), Jan JEŽEK (203 Česká republika), Martin ŠILER (203 Česká republika), Mojmir ŠERÝ (203 Česká republika), Vladislav KRZYŽÁNEK (203 Česká republika), Kamila HRUBANOVÁ (203 Česká republika), Pavel ZEMÁNEK (203 Česká republika), Veronika HOLÁ (203 Česká republika, domácí) a Filip RŮŽIČKA (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Journal of Biomedical Optics, Bellingham, SPIE, 2015, 1083-3668

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.556

Kód RIV

RIV/00216224:14110/15:00080989

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1117/1.JBO.20.5.051038

UT WoS

000356241900043

Klíčová slova anglicky

Raman tweezers; Staphylococcus epidermidis; biofilm

Štítky

EL OK

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 3. 11. 2015 11:48, Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková

Anotace

V originále

A method for in vitro identification of individual bacterial cells is presented. The method is based on a combination of optical tweezers for spatial trapping of individual bacterial cells and Raman microspectroscopy for acquisition of spectral "Raman fingerprints" obtained from the trapped cell. Here, Raman spectra were taken from the biofilm-forming cells without the influence of an extracellular matrix and were compared with biofilmnegative cells. Results of principal component analyses of Raman spectra enabled us to distinguish between the two strains of Staphylococcus epidermidis. Thus, we propose that Raman tweezers can become the technique of choice for a clearer understanding of the processes involved in bacterial biofilms which constitute a highly privileged way of life for bacteria, protected from the external environment.

Návaznosti

GAP205/11/1687, projekt VaV

Název: Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace

Investor: Grantová agentura ČR, Neinvazní bezkontaktní metody identifikace a charakterizace živých mikroorganismů prostřednictvím optické spektroskopie a mikromanipulace

NS9678, projekt VaV

Název: Biofilm - významný faktor virulence u infekcí močových katétrů; detekce a možnosti ovlivnění

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Biofilm - významný faktor virulence u infekcí močových katétrů, detekce a možnosti ovlivnění

Citovat

SAMEK, Ota, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Martin ŠILER, Mojmir ŠERÝ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Kamila HRUBANOVÁ, Pavel ZEMÁNEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers. Journal of Biomedical Optics. Bellingham: SPIE, 2015, roč. 20, č. 5, s. "051038-1"-"051038-6", 6 s. ISSN 1083-3668. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/1.JBO.20.5.051038.

@article{1309673,
   author = {Samek, Ota and Bernatová, Silvie and Ježek, Jan and Šiler, Martin and Šerý, Mojmir and Krzyžánek, Vladislav and Hrubanová, Kamila and Zemánek, Pavel and Holá, Veronika and Růžička, Filip},
   article_location = {Bellingham},
   article_number = {5},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1117/1.JBO.20.5.051038},
   keywords = {Raman tweezers; Staphylococcus epidermidis; biofilm},
   language = {eng},
   issn = {1083-3668},
   journal = {Journal of Biomedical Optics},
   title = {Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers},
   volume = {20},
   year = {2015}
}

TY  - JOUR
ID  - 1309673
AU  - Samek, Ota - Bernatová, Silvie - Ježek, Jan - Šiler, Martin - Šerý, Mojmir - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Zemánek, Pavel - Holá, Veronika - Růžička, Filip
PY  - 2015
TI  - Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers
JF  - Journal of Biomedical Optics
VL  - 20
IS  - 5
SP  - "051038-1"-"051038-6"
EP  - "051038-1"-"051038-6"
PB  - SPIE
SN  - 10833668
KW  - Raman tweezers
KW  - Staphylococcus epidermidis
KW  - biofilm
N2  - A method for in vitro identification of individual bacterial cells is presented. The method is based on a combination of optical tweezers for spatial trapping of individual bacterial cells and Raman microspectroscopy for acquisition of spectral "Raman fingerprints" obtained from the trapped cell. Here, Raman spectra were taken from the biofilm-forming cells without the influence of an extracellular matrix and were compared with biofilmnegative cells. Results of principal component analyses of Raman spectra enabled us to distinguish between the two strains of Staphylococcus epidermidis. Thus, we propose that Raman tweezers can become the technique of choice for a clearer understanding of the processes involved in bacterial biofilms which constitute a highly privileged way of life for bacteria, protected from the external environment.
ER  -

SAMEK, Ota, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Martin ŠILER, Mojmir ŠERÝ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Kamila HRUBANOVÁ, Pavel ZEMÁNEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers. \textit{Journal of Biomedical Optics}. Bellingham: SPIE, 2015, roč.~20, č.~5, s.~''051038-1''-''051038-6'', 6 s. ISSN~1083-3668. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/1.JBO.20.5.051038.

Podrobný výpis o publikaci