J 2015

Evaluation of the MALDI-TOF MS profiling for identification of newly described Aeromonas spp.

VÁVROVÁ, Andrea, Tereza BALÁŽOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Ludmila TVRZOVÁ, Ondrej ŠEDO et. al.

Základní údaje

Originální název

Evaluation of the MALDI-TOF MS profiling for identification of newly described Aeromonas spp.

Autoři

VÁVROVÁ, Andrea (203 Česká republika, garant, domácí), Tereza BALÁŽOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Ludmila TVRZOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Folia Microbiologica, AV ČR, Institute of Microbiology, 2015, 0015-5632

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.335

Kód RIV

RIV/00216224:14310/15:00080481

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

UT WoS

000359398900002

Klíčová slova anglicky

DESORPTION/IONIZATION-MASS SPECTROMETRY; GENUS AEROMONAS; SP-NOV.; PHYLOGENETIC ANALYSIS; HYDROPHILA; AQUARIORUM; WATER; ENTEROPELOGENES; BACTERIA; STRAINS

Štítky

Změněno: 13. 10. 2015 14:54, Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.

Anotace

V originále

The genus Aeromonas comprises primarily aquatic bacteria and also serious human and animal pathogens with the occurrence in clinical material, drinking water, and food. Aeromonads are typical for their complex taxonomy and nomenclature and for limited possibilities of identification to the species level. According to studies describing the use of MALDI-TOF MS in diagnostics of aeromonads, this modern chemotaxonomical approach reveals quite high percentage of correctly identified isolates. We analyzed 64 Aeromonas reference strains from the set of 27 species. After extending the range of analyzed Aeromonas species by newly described ones, we proved that MALDI-TOF MS procedure accompanied by Biotyper tool is not a reliable diagnostic technique for aeromonads. We obtained quite high percentage of false-positive, incorrect, and uncertain results. The identification of newly described species is accompanied with misidentifications that were observed also in the case of pathogenic aeromonads.

Návaznosti

CZ.1.05/1.1.00/02.0068, interní kód MU
Název: CEITEC - středoevropský technologický institut (Akronym: CEITEC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC - středoevropský technologický institut, 1.1 Evropská centra excelence
CZ.1.07/2.3.00/20.0183, interní kód MU
Název: Centrum experimentální biomedicíny (Akronym: CEB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum experimentální biomedicíny, 2.3 Lidské zdroje ve výzkumu a vývoji
MUNI/A/0884/2013, interní kód MU
Název: Podpora výzkumných aktivit studentů mikrobiologie (Akronym: MIKROB)
Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumných aktivit studentů mikrobiologie, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
QI101A094, projekt VaV
Název: Metody tlumení produkčních chorob skotu - BVD-MD a paratuberkulóza
Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Metody tlumení produkčních chorob skotu - BVD-MD a paratuberkulóza, Udržitelný rozvoj agrárního sektoru