ABATE, Alessandro, Milan ČEŠKA, Luboš BRIM a Marta KWIATKOWSKA. Adaptive Aggregation of Markov Chains: Quantitative Analysis of Chemical Reaction Networks. In 27th International Conference, CAV 2015, San Francisco, CA, USA, July 18-24, 2015, Proceedings. LNCS 9206. Berlin: Springer International Publishing, 2015, s. 195-213. ISBN 978-3-319-21689-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-21690-4_12.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Adaptive Aggregation of Markov Chains: Quantitative Analysis of Chemical Reaction Networks
Autoři ABATE, Alessandro (826 Velká Británie a Severní Irsko), Milan ČEŠKA (203 Česká republika, domácí), Luboš BRIM (203 Česká republika, garant, domácí) a Marta KWIATKOWSKA (826 Velká Británie a Severní Irsko).
Vydání LNCS 9206. Berlin, 27th International Conference, CAV 2015, San Francisco, CA, USA, July 18-24, 2015, Proceedings, od s. 195-213, 19 s. 2015.
Nakladatel Springer International Publishing
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 0.402 v roce 2005
Kód RIV RIV/00216224:14330/15:00081179
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-3-319-21689-8
ISSN 0302-9743
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-21690-4_12
UT WoS 000364182900012
Klíčová slova anglicky continuous-time Markov chains; parameter exploration; model checking
Štítky core_A, firank_1
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 16. 4. 2019 09:39.
Anotace
Quantitative analysis of Markov models typically proceeds through numerical methods or simulation-based evaluation. Since the state space of the models can often be large, exact or approximate state aggregation methods (such as lumping or bisimulation reduction) have been proposed to improve the scalability of the numerical schemes. However, none of the existing numerical techniques provides general, explicit bounds on the approximation error, a problem particularly relevant when the level of accuracy affects the soundness of verification results. We propose a novel numerical approach that combines the strengths of aggregation techniques (state-space reduction) with those of simulation-based approaches (automatic updates that adapt to the process dynamics). The key advantage of our scheme is that it provides rigorous precision guarantees under different measures. The new approach, which can be used in conjunction with time uniformisation techniques, is evaluated on two models of chemical reaction networks, a signalling pathway and a prokaryotic gene expression network: it demonstrates marked improvement in accuracy without performance degradation, particularly when compared to known state-space truncation techniques.
Návaznosti
GA15-11089S, projekt VaVNázev: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
Investor: Grantová agentura ČR, Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
VytisknoutZobrazeno: 18. 9. 2024 07:24