KŘÍŽOVÁ, Lenka, Martina MAIXNEROVÁ, Ondrej ŠEDO a Alexandr NEMEC. Acinetobacter albensis sp nov., isolated from natural soil and water ecosystems. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Berks (UK): Society for General Microbiology, 2015, roč. 65, neuvedeno, s. 3905-3912. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.000511.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Acinetobacter albensis sp nov., isolated from natural soil and water ecosystems
Autoři KŘÍŽOVÁ, Lenka (203 Česká republika), Martina MAIXNEROVÁ (203 Česká republika), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, garant, domácí) a Alexandr NEMEC (203 Česká republika).
Vydání International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Berks (UK), Society for General Microbiology, 2015, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.439
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00081635
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.000511
UT WoS 000369637800024
Klíčová slova anglicky 16S rRNA gene; RpoB gene; GyrB gene; MALDI-ToF MS; Phenotype
Štítky rivok
Změnil Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 16:50.
Anotace
We have studied the taxonomic position of a phenetically unique group of eight strains of the genus Acinetobacter which were isolated from soil and water samples collected in protected landscape areas in the Czech Republic. Each of the comparative sequence analyses of the 16S rRNA, gyrB and rpoB genes showed that the eight strains formed a cohesive and tight cluster (intracluster sequence identities of >= 99.9 %, >= 98.5 % and >= 97.7 %, respectively), which was clearly separated from all hitherto known species of the genus Acinetobacter (<= 98.6 %, <= 84.5 % and <= 89.3 %, respectively). Congruent with these findings were the results of comparative sequence analysis of three additional housekeeping genes (gltA, pyrG and recA). This genotypic distinctness was mirrored by the uniqueness of the combination of a number of independent phenotypic markers including the whole-cell spectra produced by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-ToF) MS and physiological and metabolic features. The most useful phenotypic features to differentiate the eight strains from all known species of the genus Acinetobacter were the ability to assimilate tricarballylate and the inability to grow at 35 degrees C or to assimilate ethanol or L-histidine. We conclude that the eight strains represent a novel environmental species for which the name Acinetobacter albensis sp. nov. is proposed. The type strain is ANC 4874(T) (=CCUG 67281(T)=CCM 8611(T)).
Návaznosti
GA13-26693S, projekt VaVNázev: Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.
Investor: Grantová agentura ČR, Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech
VytisknoutZobrazeno: 19. 8. 2024 14:32