ŠTOURAČ, Jan, Jaroslav BENDL, Eva ŠEBESTOVÁ, Ondřej VÁVRA, Miloš MUSIL, Jan BREZOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. HotSpot Wizard 2.0. 2015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název HotSpot Wizard 2.0
Autoři ŠTOURAČ, Jan (203 Česká republika, domácí), Jaroslav BENDL (203 Česká republika, domácí), Eva ŠEBESTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ondřej VÁVRA (203 Česká republika, domácí), Miloš MUSIL (203 Česká republika, domácí), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí) a Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání 2015.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Software
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/15:00080424
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky proteinové inženýrství, design chytrých knihoven, výpočetní mutageneze, predikce hotspotů
Klíčová slova anglicky protein engineering; smart library design; computational mutagenesis; hotspot prediction
Technické parametry Integrated platform for protein engineering.
Štítky AKR
Změnil Změnil: Ing. Jaroslav Bendl, učo 403454. Změněno: 23. 5. 2016 14:10.
Anotace
HotSpot Wizard is a web server for automatic identification of hot spots for engineering of substrate specificity, activity or entantioselectivity of enzymes and for annotation of protein structures. HSW 2.0 integrates 3 databases and 18 computational tools, including our in-house tool for analysis of protein tunnels and channels Caver 3.0. In the output, users can explore hot spots based on 4 protein engineering strategies: (i) functional hot spots represented by highly mutable residues located in the active site pocket or access tunnels, (ii) stability hot spots represented by flexible residues, (iii) stability hot spots identified by back-to-consensus approach, and (iv) correlated hot spots represented by pairs of coevolving residues that modulate enzyme activity and selectivity.
Návaznosti
TA04021380, projekt VaVNázev: Biosenzor pro monitorování toxických látek v životním prostředí
Investor: Technologická agentura ČR, Biosenzor pro monitorování toxických látek v životním prostředí
VytisknoutZobrazeno: 19. 8. 2024 06:30