Detailed Information on Publication Record
2016
Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů
LENGEROVÁ, Martina, Matěj BEZDÍČEK, Zdeněk RÁČIL, Jiří MAYER, Iva KOCMANOVÁ et. al.Basic information
Original name
Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů
Name (in English)
Kit for detection and identification of mycotic pathogens
Authors
LENGEROVÁ, Martina (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Matěj BEZDÍČEK (203 Czech Republic), Zdeněk RÁČIL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jiří MAYER (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Iva KOCMANOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
2016
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Výsledky s právní ochranou
Field of Study
30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
RIV identification code
RIV/00216224:14740/16:00087615
Organization unit
Central European Institute of Technology
Keywords (in Czech)
invazivní mykotické infekce; molekulární diagnostika; analýza teplot tání s vysokým rozlišením; panfungální PCR
Keywords in English
invasive fungal disease; molecular diagnostics; high resolution melting analysis; panfungal PCR
Tags
Změněno: 3/5/2017 08:54, Mgr. Eva Špillingová
V originále
I přes pokroky v léčbě zůstává míra mortality u invazivních houbových infekcí vysoká. Vzhledem k rozšiřujícímu se spektru možných původců je nezbytná rychlá a přesná diagnostika těchto infekcí. Námi předložená metoda panfungální PCR cílí na vysoce variabilní úsek ITS2 v oblasti rDNA genů a využívá analýzu teplot tání s vysokým rozlišením k druhové identifikaci patogena. V důsledku vysoké variability úseku ITS2 získáme rozdílné teploty tání pro rozdílné druhy fungálních patogenů, díky čemuž jsme schopni patogen identifikovat bez použití časově i finančně náročné sekvenace. Vysoká specificita, pozitivní i negativní prediktivní hodnota, rychlost a časová nenáročnost předložené metody ji činí vhodnou zejména pro rychlý screening vzorků od pacientů v riziku invazivní houbové infekce.
In English
Despite advances in the treatment of invasive fungal diseases, mortality rates remain high. Moreover, due to the expanding spectrum of causative agents, fast and accurate pathogen identification is necessary. We designed a panfungal PCR which targets the highly variable ITS2 region of rDNA genes and uses high resolution melting analysis for subsequent species identification. High ITS region variability leads to obtaining divergent melting peaks for different fungal species and omission of the expensive and time consuming sequencing step is possible. With the high specificity, positive and negative predictive values, short time needed to obtain a result, and low price, the presented assay is intended to be used as a quick screening method for patients at risk of invasive fungal diseases.
Links
| TE02000058, research and development project |
|