STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1

k 2016

STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1

SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK et. al.

Základní údaje

Originální název

STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1

Autoři

SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO

Vydání

XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, 2016

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Prezentace na konferencích

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Změněno: 23. 9. 2016 18:04, Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc.

Anotace

V originále

Etylén je plynný rostlinný hormon, který se podílí na regulaci vývoje rostlin (např. klíčení semen, zrání ovoce, stárnutí) a na zprostředkování odpovědi k různým biotickým a abiotickým stresům1. V rostlině Arabidopsis thaliana je vnímán rodinou pěti membránově vázaných receptorů, kde dominantní roli hrají receptory ETHYLENE RESPONSE 1 (ETR1) a ETHYLENE RESPONSE SENSOR 1 (ERS1)2. ETR1 a ERS1 jsou jediné dva etylénové receptory s histidinkinázovou (HK) aktivitou (ostatní jsou Ser/Thr kinázy). Jejich HK aktivita je regulována přítomnosti dvojmocných kationtů3. Vápníkové a hořčíkové (Mg2+) kationty inhibují HK aktivitu ETR1. ERS1 má vpřítomnosti těchto kationtů Ser/Thr kinázovou aktivitu. V přítomnosti manganatého kationtu (Mn2+) mají oba receptory HK aktivitu. Předpokládáme, že by tento mechanismus mohl hrát roli jako přepínač mezi etylénovou a cytokininovou signální dráhou. Cílem naší práce je objasnit strukturní aspekty a HK aktivitu ETR1 ve vzájemné interakci etylénové a cytokininové signální dráhy. Naklonovali jsme jednotlivé intracelulární domény ETR1 (histidinkinázová a přijímačová) a připravili proteiny. U histidinkinázové domény jsme testovali kinázovou aktivitu v přítomnosti Mg2+ a Mn2+ kationtů. Zjistili jsme, že v přítomnosti Mg2+ dochází k inhibici autofosforylace. V současné době optimalizujeme metodu pro testování fosfotransferázové aktivity histidinkinázové domény. Pro studium strukturních změn vyvolaných dvojmocnými ionty jsme optimalizovali krystalizaci přijímačové domény. Testovali jsme různé teplotní podmínky, různá aditiva a různé techniky krystalizace s cílem získat krystaly s difrakcí menší než 2Å. V současné době se testuje difrakce získaných krystalů. Nukleární magnetickou spektroskopii jsme použili pro studium interakce přijímačové domény s Mg2+. Zjistili jsme, že vazba Mg2+ je velmi slabá v porovnání s jejich vazbou k přijímačové doméně jiné rostlinné histidinkinázy CYTOKININ-INDEPENDENT 1. LITERATURA 1. Abeles F.B., Morgan P.W., Saltveit M.E., Ethylene in Plant Biology, 2nd Ed. Academic Press, San Diego, CA (1992) 2. Pekarová B., Szmitkowska A., Dopitovaá R., Degtjarik O.,Zidek L., Hejatko J., Mol Plant 9:71-85 (2016). 3. Moussatche,P., Klee H.J., J Biol Chem 279:48734-48741 (2004).

Návaznosti

GA13-25280S, projekt VaV

Název: Elucidating molecular mechanisms of cytokinins-ethylene crosstalk in the plant development

Investor: Grantová agentura ČR, Elucidating molecular mechanisms of cytokinins-ethylene crosstalk in the plant development

Citovat

SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1. In XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. 2016.

@proceedings{1354850,
   author = {Szmitkowska, Agnieszka and Jaseňáková, Zuzana and Pekárová, Blanka and Komárek, Jan and Žídek, Lukáš and Wimmerová, Michaela and Hejátko, Jan},
   booktitle = {XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků},
   language = {cze},
   title = {STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1},
   url = {http://www.mezioborovesetkani.cz/program.php},
   year = {2016}
}

TY  - CONF
ID  - 1354850
AU  - Szmitkowska, Agnieszka - Jaseňáková, Zuzana - Pekárová, Blanka - Komárek, Jan - Žídek, Lukáš - Wimmerová, Michaela - Hejátko, Jan
PY  - 2016
TI  - STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1
UR  - http://www.mezioborovesetkani.cz/program.php
N2  - Etylén je plynný rostlinný hormon, který se podílí na regulaci vývoje rostlin (např. klíčení semen, zrání ovoce, stárnutí) a na zprostředkování odpovědi k různým biotickým a abiotickým stresům1. V rostlině Arabidopsis thaliana je vnímán rodinou pěti membránově vázaných receptorů, kde dominantní roli hrají receptory ETHYLENE RESPONSE 1 (ETR1) a ETHYLENE RESPONSE SENSOR 1 (ERS1)2. ETR1 a ERS1 jsou jediné dva etylénové receptory s histidinkinázovou (HK) aktivitou (ostatní jsou Ser/Thr kinázy). Jejich HK aktivita je regulována přítomnosti dvojmocných kationtů3. Vápníkové a hořčíkové (Mg2+) kationty inhibují HK aktivitu ETR1. ERS1 má vpřítomnosti těchto kationtů Ser/Thr kinázovou aktivitu. V přítomnosti manganatého kationtu (Mn2+) mají oba receptory HK aktivitu. Předpokládáme, že by tento mechanismus mohl hrát roli jako přepínač mezi etylénovou a cytokininovou signální dráhou. Cílem naší práce je objasnit strukturní aspekty a HK aktivitu ETR1 ve vzájemné interakci etylénové a cytokininové signální dráhy. Naklonovali jsme jednotlivé intracelulární domény ETR1 (histidinkinázová a přijímačová) a připravili proteiny. U histidinkinázové domény jsme testovali kinázovou aktivitu v přítomnosti Mg2+ a Mn2+ kationtů. Zjistili jsme, že v přítomnosti Mg2+ dochází k inhibici autofosforylace. V současné době optimalizujeme metodu pro testování fosfotransferázové aktivity histidinkinázové domény. Pro studium strukturních změn vyvolaných dvojmocnými ionty jsme optimalizovali krystalizaci přijímačové domény. Testovali jsme různé teplotní podmínky, různá aditiva a různé techniky krystalizace s cílem získat krystaly s difrakcí menší než 2Å. V současné době se testuje difrakce získaných krystalů. Nukleární magnetickou spektroskopii jsme použili pro studium interakce přijímačové domény s Mg2+. Zjistili jsme, že vazba Mg2+ je velmi slabá v porovnání s jejich vazbou k přijímačové doméně jiné rostlinné histidinkinázy CYTOKININ-INDEPENDENT 1. LITERATURA 1. Abeles F.B., Morgan P.W., Saltveit M.E., Ethylene in Plant Biology, 2nd Ed. Academic Press, San Diego, CA (1992) 2. Pekarová B., Szmitkowska A., Dopitovaá R., Degtjarik O.,Zidek L., Hejatko J., Mol Plant 9:71-85 (2016). 3. Moussatche,P., Klee H.J., J Biol Chem 279:48734-48741 (2004).
ER  -

SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1. In \textit{XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků}. 2016.

Podrobný výpis o publikaci