Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací
indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit

J 2016

Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit

Název česky

Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit

Název anglicky

Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies

Autoři

ZÁPRAŽNÁ, Kristína (203 Česká republika, garant, domácí), Jitka MALČÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Nikola TOM (203 Česká republika, domácí), Lenka RADOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kamila RÉBLOVÁ (203 Česká republika, domácí), M. ATCHISON (840 Spojené státy) a Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Klinická onkologie, Praha, Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, 0862-495X

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14740/16:00091804

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova anglicky

activation; induced deaminase; somatic hypermutation; immunoglobulin; alternative splicing; CLL

Štítky

rivok

Změněno: 28. 3. 2017 10:55, Mgr. Eva Špillingová

Anotace

ORIG EN

V originále

Úvod: Aktivací indukovaná deamináza (AID) hraje významnou roli při zvyšování efektivity protilátek ve zralých B lymfocytech během imunitní odpovědi. AID vnáší somatické hypermutace (SHM) primárně do imunoglobulinových (Ig) genů a hraje roli také v přesmyku Ig tříd (CSR). Tento enzym má obrovský mutační potenciál – frekvence SHM v Ig je až milionkrát vyšší než frekvence spontánní mutageneze. Studium AID v myších modelech prokázalo souvislost mezi aktivitou AID a množstvím změn v celém genomu (mutace, zlomy, translokace). AID je aberantně exprimovaná u B buněčných malignit i u řady solidních nádorů. U chronické lymfocytární leukemie (CLL), Ph akutní lymfoblastické leukemie a lymfomu z plášťových buněk podléhá AID alternativnímu sestřihu. Ve srovnání se zdravými B lymfocyty se zde navíc vyskytují čtyři alternativně sestřižené transkripty AID, které se liší od standardní varianty AID v C terminální doméně. Cíl: Tento projekt má za úkol objasnit, zda delece a inzerce v C terminální doméně AID mění její funkční vlastnosti. Materiál a metody: Alternativně sestřižené transkripty AID detekované ve vzorku periferní krve CLL pacienta byly naklonovány do retrovirového vektoru. Zralé B lymfocyty purifikované ze slezin AID myší byly stimulovány cytokiny a poté infikovány retroviry exprimující jednotlivé sestřihové varianty AID. Po čtyřdenní kultivaci jsme s pomocí průtokové cytometrie hodnotili CSR. Genomická DNA byla podrobena analýze zlomů a mutací v oblasti přesmyku Ig Sm. Zlomy byly detekovány pomocí ligační PCR a hybridizace s radioaktivně značenou sondou. Mutační analýzu jsme provedli pomocí ultra-hlubokého sekvenování nové generace. Výsledky: Zatímco standardní varianta AID indukovala somatické hypermutace, zlomy i přesmyk Ig izotypů, alternativně sestřižené varianty AID se ve všech použitých funkčních testech jevily jako katalyticky neaktivní. CSR, indukce mutací i dvouřetězcových zlomů v Ig Sm byly v buňkách exprimujících alternativně sestřižené AID transkripty pod hranicí detekce použitých esejí. Závěr: Výsledky analýzy aktivity sestřihových variant AID v myších stimulovaných B buňkách (AID) poukazují na ztrátu funkce. Role sestřihových variant AID exprimovaných u CLL zůstává nejasná a jejich funkce je třeba dále analyzovat za použití lidských linií odvozených z B buněčných malignit a klinických vzorků. Výzkum je financován z programu SoMoPro II, který je podpořen EU (REA č. 291782). Výzkum je dále spolufinancován JMK. Tento materiál odráží pouze postoje autora a EU není odpovědná za jakékoli možné použití informací obsažených v takovém materiálu.

Anglicky

Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies, Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies, Studying the function splicing variants of activation-induced deaminase in B cell malignancies

Návaznosti

3SGA5792, interní kód MU

Název: Expression and function of activation-induced cytidine deaminase splice variants in normal B cell physiology and chronic lymphocytic leukemia (Akronym: AIDinCLL)

Investor: Jihomoravský kraj, Expression and function of activation-induced cytidine deaminase splice variants in normal B cell physiology and chronic lymphocytic leukemia, Reintegrační granty

Citovat

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, M. ATCHISON a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit. Klinická onkologie. Praha: Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, roč. 29, Supplementum 2, s. 142-143. ISSN 0862-495X.

@article{1361278,
   author = {Zápražná, Kristína and Malčíková, Jitka and Tom, Nikola and Radová, Lenka and Réblová, Kamila and Atchison, M. and Pospíšilová, Šárka},
   article_location = {Praha},
   article_number = {Supplementum 2},
   keywords = {activation; induced deaminase; somatic hypermutation; immunoglobulin; alternative splicing; CLL},
   language = {cze},
   issn = {0862-495X},
   journal = {Klinická onkologie},
   title = {Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit},
   url = {http://www.linkos.cz/casopis-klinicka-onkologie/archiv/detail/cislo/2016-4-27-supplementum-2/},
   volume = {29},
   year = {2016}
}

TY  - JOUR
ID  - 1361278
AU  - Zápražná, Kristína - Malčíková, Jitka - Tom, Nikola - Radová, Lenka - Réblová, Kamila - Atchison, M. - Pospíšilová, Šárka
PY  - 2016
TI  - Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit
JF  - Klinická onkologie
VL  - 29
IS  - Supplementum 2
SP  - 142-143
EP  - 142-143
PB  - Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně
SN  - 0862495X
KW  - activation
KW  - induced deaminase
KW  - somatic hypermutation
KW  - immunoglobulin
KW  - alternative splicing
KW  - CLL
UR  - http://www.linkos.cz/casopis-klinicka-onkologie/archiv/detail/cislo/2016-4-27-supplementum-2/
L2  - http://www.linkos.cz/casopis-klinicka-onkologie/archiv/detail/cislo/2016-4-27-supplementum-2/
N2  - Úvod: Aktivací indukovaná deamináza (AID) hraje významnou roli při zvyšování efektivity protilátek ve zralých B lymfocytech během imunitní odpovědi. AID vnáší somatické hypermutace (SHM) primárně do imunoglobulinových (Ig) genů a hraje roli také v přesmyku Ig tříd (CSR). Tento enzym má obrovský mutační potenciál – frekvence SHM v Ig je až milionkrát vyšší než frekvence spontánní mutageneze. Studium AID v myších modelech prokázalo souvislost mezi aktivitou AID a množstvím změn v celém genomu (mutace, zlomy, translokace). AID je aberantně exprimovaná u B buněčných malignit i u řady solidních nádorů. U chronické lymfocytární leukemie (CLL), Ph akutní lymfoblastické leukemie a lymfomu z plášťových buněk podléhá AID alternativnímu sestřihu. Ve srovnání se zdravými B lymfocyty se zde navíc vyskytují čtyři alternativně sestřižené transkripty AID, které se liší od standardní varianty AID v C terminální doméně. Cíl: Tento projekt má za úkol objasnit, zda delece a inzerce v C terminální doméně AID mění její funkční vlastnosti. Materiál a metody: Alternativně sestřižené transkripty AID detekované ve vzorku periferní krve CLL pacienta byly naklonovány do retrovirového vektoru. Zralé B lymfocyty purifikované ze slezin AID myší byly stimulovány cytokiny a poté infikovány retroviry exprimující jednotlivé sestřihové varianty AID. Po čtyřdenní kultivaci jsme s pomocí průtokové cytometrie hodnotili CSR. Genomická DNA byla podrobena analýze zlomů a mutací v oblasti přesmyku Ig Sm. Zlomy byly detekovány pomocí ligační PCR a hybridizace s radioaktivně značenou sondou. Mutační analýzu jsme provedli pomocí ultra-hlubokého sekvenování nové generace. Výsledky: Zatímco standardní varianta AID indukovala somatické hypermutace, zlomy i přesmyk Ig izotypů, alternativně sestřižené varianty AID se ve všech použitých funkčních testech jevily jako katalyticky neaktivní. CSR, indukce mutací i dvouřetězcových zlomů v Ig Sm byly v buňkách exprimujících alternativně sestřižené AID transkripty pod hranicí detekce použitých esejí. Závěr: Výsledky analýzy aktivity sestřihových variant AID v myších stimulovaných B buňkách (AID) poukazují na ztrátu funkce. Role sestřihových variant AID exprimovaných u CLL zůstává nejasná a jejich funkce je třeba dále analyzovat za použití lidských linií odvozených z B buněčných malignit a klinických vzorků. Výzkum je financován z programu SoMoPro II, který je podpořen EU (REA č. 291782). Výzkum je dále spolufinancován JMK. Tento materiál odráží pouze postoje autora a EU není odpovědná za jakékoli možné použití informací obsažených v takovém materiálu.
ER  -

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, M. ATCHISON a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit. \textit{Klinická onkologie}. Praha: Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, roč.~29, Supplementum 2, s.~142-143. ISSN~0862-495X.

Podrobný výpis o publikaci