E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology
of Cyanobacteria

D 2016

E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria

TROJÁK, Matej, David ŠAFRÁNEK, Jakub HRABEC, Jakub ŠALAGOVIČ, Františka ROMANOVSKÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria

Autoři

TROJÁK, Matej (703 Slovensko, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant, domácí), Jakub HRABEC (203 Česká republika, domácí), Jakub ŠALAGOVIČ (703 Slovensko, domácí), Františka ROMANOVSKÁ (203 Česká republika, domácí) a Jan ČERVENÝ (203 Česká republika)

Vydání

Heidelberg, Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016. od s. 316-322, 7 s. 2016

Nakladatel

Springer

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 0.402 v roce 2005

Kód RIV

RIV/00216224:14330/16:00088449

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-3-319-45176-3

ISSN

DOI

http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_20

UT WoS

000460685100020

Klíčová slova anglicky

systems biology; model repository; model analysis; model specification

Štítky

firank_B

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 13. 5. 2020 19:25, RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D.

Anotace

V originále

E-cyanobacterium.org is an online platform providing tools for public sharing, annotation, analysis, and visualization of dynamical models and wet-lab experiments related to cyanobacteria. The platform is unique in integrating abstract mathematical models with a precise consortium-agreed biochemical description provided in a rule-based formalism. The general aim is to stimulate collaboration between experimental and computational systems biologists to achieve better understanding of cyanobacteria.

Návaznosti

GA15-11089S, projekt VaV

Název: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů

Investor: Grantová agentura ČR, Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů

LM2015055, projekt VaV

Název: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology

Citovat

TROJÁK, Matej, David ŠAFRÁNEK, Jakub HRABEC, Jakub ŠALAGOVIČ, Františka ROMANOVSKÁ a Jan ČERVENÝ. E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria. In Ezio Bartocci et al. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016. Heidelberg: Springer, 2016, s. 316-322. ISBN 978-3-319-45176-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_20.

@inproceedings{1365006,
   author = {Troják, Matej and Šafránek, David and Hrabec, Jakub and Šalagovič, Jakub and Romanovská, Františka and Červený, Jan},
   address = {Heidelberg},
   booktitle = {Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016.},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_20},
   editor = {Ezio Bartocci et al.},
   keywords = {systems biology; model repository; model analysis; model specification},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {eng},
   location = {Heidelberg},
   isbn = {978-3-319-45176-3},
   pages = {316-322},
   publisher = {Springer},
   title = {E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria},
   url = {http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-319-45177-0_20},
   year = {2016}
}

TY  - JOUR
ID  - 1365006
AU  - Troják, Matej - Šafránek, David - Hrabec, Jakub - Šalagovič, Jakub - Romanovská, Františka - Červený, Jan
PY  - 2016
TI  - E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria
PB  - Springer
CY  - Heidelberg
SN  - 9783319451763
KW  - systems biology
KW  - model repository
KW  - model analysis
KW  - model specification
UR  - http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-319-45177-0_20
N2  - E-cyanobacterium.org is an online platform providing tools for public sharing, annotation, analysis, and visualization of dynamical models and wet-lab experiments related to cyanobacteria. The platform is unique in integrating abstract mathematical models with a precise consortium-agreed biochemical description provided in a rule-based formalism. The general aim is to stimulate collaboration between experimental and computational systems biologists to achieve better understanding of cyanobacteria.
ER  -

TROJÁK, Matej, David ŠAFRÁNEK, Jakub HRABEC, Jakub ŠALAGOVIČ, Františka ROMANOVSKÁ a Jan ČERVENÝ. E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria. In Ezio Bartocci et al. \textit{Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016.}. Heidelberg: Springer, 2016, s.~316-322. ISBN~978-3-319-45176-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0\_{}20.

Podrobný výpis o publikaci