YADAV, Deepak Kumar a Peter LUKAVSKY. NMR solution structure determination of large RNA-protein complexes. PROGRESS IN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY. OXFORD: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2016, roč. 97, November, s. 57-81. ISSN 0079-6565. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.pnmrs.2016.10.001.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název NMR solution structure determination of large RNA-protein complexes
Autoři YADAV, Deepak Kumar (356 Indie, domácí) a Peter LUKAVSKY (40 Rakousko, garant, domácí).
Vydání PROGRESS IN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY, OXFORD, PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2016, 0079-6565.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 5.971
Kód RIV RIV/00216224:14740/16:00088765
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.pnmrs.2016.10.001
UT WoS 000390507100003
Klíčová slova anglicky Biomolecular NMR; RNA-protein complex; NMR assignments; NMR structure determination; RNA-protein interaction; Isotope labeling; Integrated structural biology
Štítky CF NMR, rivok
Změnil Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 10. 3. 2017 09:39.
Anotace
Structure determination of RNA-protein complexes is essential for our understanding of the multiple layers of RNA-mediated posttranscriptional regulation of gene expression. Over the past 20 years, NMR spectroscopy became a key tool for structural studies of RNA-protein interactions. Here, we review the progress being made in NMR structure determination of large ribonucleoprotein assemblies. We discuss approaches for the design of RNA-protein complexes for NMR structural studies, established and emerging isotope and segmental labeling schemes suitable for large RNPs and how to gain distance restraints from NOEs, PREs and EPR and orientational information from RDCs and SAXS/SANS in such systems. the new combination of NMR measurements with MD simulations and its potential will also be discussed. Application and combination of these various methods for structure determination of large RNPs will be illustrated with three large RNA-protein complexes (>40 kDa) and other interesting complexes determined in the past six and a half years. (C) 2016 Elsevier B.V. All rights reserved.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0042, projekt VaVNázev: Internacionalizace programu Strukturní biologie s důrazem na rozvoj nových směrů výzkumu
GA15-21122S, projekt VaVNázev: Strukturní podstata změn v sestřihu způsobující cystickou fibrózu
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní podstata změn v sestřihu způsobující cystickou fibrózu
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 18. 5. 2024 09:13