Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících
exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

D 2017

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ et. al.

Základní údaje

Originální název

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

Název česky

Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

Název anglicky

Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains

Autoři

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ

Vydání

1. vyd. Brno, XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017, s. 50-50, 2017

Nakladatel

Masarykova Univerzita

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Odkazy

XXVI. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-210-8585-5

Klíčová slova česky

ETB plazmid, exfoliativní toxin B, fylogeneze, genomová analýza

Klíčová slova anglicky

ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis

Štítky

Změněno: 19. 4. 2018 14:45, Ing. Nicole Zrilić

Anotace

V originále

Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.

Návaznosti

QJ1510216, projekt VaV

Název: Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat (Akronym: StafyFag)

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat

Citovat

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus. In Lukáš Vacek. XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017. 1. vyd. Brno: Masarykova Univerzita, 2017, s. 50. ISBN 978-80-210-8585-5.

@inproceedings{1382679,
   author = {Botka, Tibor and Růžičková, Vladislava and Svobodová, Karla and Pantůček, Roman and Petráš, Petr and Čejková, Darina and Doškař, Jiří},
   address = {Brno},
   booktitle = {XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017},
   edition = {1.},
   editor = {Lukáš Vacek},
   keywords = {ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {978-80-210-8585-5},
   note = {Nepřenášíme do RIV, výsledek má jen 1 stranu, podle metodiky M17+ musí mít stať ve sborníku min. 2 strany.},
   pages = {50-50},
   publisher = {Masarykova Univerzita},
   title = {Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus},
   url = {http://www.med.muni.cz/tomdny/},
   year = {2017}
}

TY  - JOUR
ID  - 1382679
AU  - Botka, Tibor - Růžičková, Vladislava - Svobodová, Karla - Pantůček, Roman - Petráš, Petr - Čejková, Darina - Doškař, Jiří
PY  - 2017
TI  - Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus
PB  - Masarykova Univerzita
CY  - Brno
SN  - 9788021085855
N1  - Nepřenášíme do RIV, výsledek má jen 1 stranu, podle metodiky M17+ musí mít stať ve sborníku min. 2 strany.
KW  - ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis
UR  - http://www.med.muni.cz/tomdny/
N2  - Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.
ER  -

BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus. In Lukáš Vacek. \textit{XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017}. 1. vyd. Brno: Masarykova Univerzita, 2017, s.~50. ISBN~978-80-210-8585-5.

Podrobný výpis o publikaci